EIF4A2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF4A2, BM-010, DDX2B, EIF4A, EIF4F, eIF-4A-II, eIF4A-II, eukaryotic translation initiation factor 4A2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601102 MGI: 106906 HomoloGene: 1487 GeneCards: EIF4A2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • translation initiation factor activity • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • perinuclear region of cytoplasm • eukaryotic translation initiation factor 4F complex • ядерце |
---|
Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • RNA secondary structure unwinding • GO:0022415 viral process • negative regulation of RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • Біосинтез білків • regulation of translational initiation • translational initiation • cellular response to leukemia inhibitory factor |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001123037 NM_001123038 NM_013506 NM_001347179 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001116509 NP_001116510 NP_001334108 NP_038534 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 186.78 – 186.79 Mb | Хр. 16: 22.93 – 22.93 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF4A2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 402[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSGGSADYNR | | EHGGPEGMDP | | DGVIESNWNE | | IVDNFDDMNL | | KESLLRGIYA |
YGFEKPSAIQ | | QRAIIPCIKG | | YDVIAQAQSG | | TGKTATFAIS | | ILQQLEIEFK |
ETQALVLAPT | | RELAQQIQKV | | ILALGDYMGA | | TCHACIGGTN | | VRNEMQKLQA |
EAPHIVVGTP | | GRVFDMLNRR | | YLSPKWIKMF | | VLDEADEMLS | | RGFKDQIYEI |
FQKLNTSIQV | | VLLSATMPTD | | VLEVTKKFMR | | DPIRILVKKE | | ELTLEGIKQF |
YINVEREEWK | | LDTLCDLYET | | LTITQAVIFL | | NTRRKVDWLT | | EKMHARDFTV |
SALHGDMDQK | | ERDVIMREFR | | SGSSRVLITT | | DLLARGIDVQ | | QVSLVINYDL |
PTNRENYIHR | | IGRGGRFGRK | | GVAINFVTEE | | DKRILRDIET | | FYNTTVEEMP |
MNVADLI |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Li W., Belsham G.J., Proud C.G. (2001). Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo. J. Biol. Chem. 276: 29111—29115. PMID 11408474 DOI:10.1074/jbc.C100284200
- Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
- Feng P., Everly D.N. Jr., Read G.S. (2005). mRNA decay during herpes simplex virus (HSV) infections: protein-protein interactions involving the HSV virion host shutoff protein and translation factors eIF4H and eIF4A. J. Virol. 79: 9651—9664. PMID 16014927 DOI:10.1128/JVI.79.15.9651-9664.2005
- Sudo K., Takahashi E., Nakamura Y. (1995). Isolation and mapping of the human EIF4A2 gene homologous to the murine protein synthesis initiation factor 4A-II gene Eif4a2. Cytogenet. Cell Genet. 71: 385—388. PMID 8521730
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3284 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q14240 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
підрозділ 40S | |
---|
|
---|
Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|