KCNAB2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1ZSX

Ідентифікатори

Символи

KCNAB2, AKR6A5, HKvbeta2, HKvbeta2.1, HKvbeta2.2, KCNA2B, KV-BETA-2, potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2

Зовнішні ІД

OMIM: 601142 MGI: 109239 HomoloGene: 56492 GeneCards: KCNAB2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• aldo-keto reductase (NADP) activity • voltage-gated ion channel activity • potassium channel regulator activity • voltage-gated potassium channel activity • oxidoreductase activity
Клітинна компонента	• axon terminus • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • синапс • аксон • міжклітинні контакти • pinceau fiber • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • juxtaparanode region of axon • specific granule membrane • tertiary granule membrane
Біологічний процес	• NADPH oxidation • regulation of protein localization to cell surface • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • neuromuscular process • hematopoietic progenitor cell differentiation • potassium ion transmembrane transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • neutrophil degranulation • ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8514


16498

Ensembl


ENSG00000069424


ENSMUSG00000028931

UniProt


Q13303


P62482

RefSeq (мРНК)

NM_001199860 NM_001199861 NM_001199862 NM_001199863 NM_003636
NM_172130

NM_001252654 NM_001252655 NM_001252656 NM_010598 NM_001355172
NM_001355173

RefSeq (білок)

NP_001186789 NP_001186790 NP_001186791 NP_001186792 NP_003627
NP_742128 NP_001186789.1 NP_001186790.1 NP_003627.1

NP_001239583 NP_001239584 NP_001239585 NP_034728 NP_001342101
NP_001342102

Локус (UCSC)

Хр. 1: 5.99 – 6.1 Mb

Хр. 4: 152.48 – 152.56 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNAB2 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily A regulatory beta subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 41 000^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYPESTTGSP	ARLSLRQTGS	PGMIYSTRYG	SPKRQLQFYR	NLGKSGLRVS
CLGLGTWVTF	GGQITDEMAE	QLMTLAYDNG	INLFDTAEVY	AAGKAEVVLG
NIIKKKGWRR	SSLVITTKIF	WGGKAETERG	LSRKHIIEGL	KASLERLQLE
YVDVVFANRP	DPNTPMEETV	RAMTHVINQG	MAMYWGTSRW	SSMEIMEAYS
VARQFNLTPP	ICEQAEYHMF	QREKVEVQLP	ELFHKIGVGA	MTWSPLACGI
VSGKYDSGIP	PYSRASLKGY	QWLKDKILSE	EGRRQQAKLK	ELQAIAERLG
CTLPQLAIAW	CLRNEGVSSV	LLGASNADQL	MENIGAIQVL	PKLSSSIIHE
IDSILGNKPY	SKKDYRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з калію, НАДФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Mccormack K., McCormack T., Tanouye M.A., Rudy B., Stuehmer W. (1995). Alternative splicing of the human Shaker K+ channel beta 1 gene and functional expression of the beta 2 gene product. FEBS Lett. 370: 32—36. PMID 7649300 DOI:10.1016/0014-5793(95)00785-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rasband M.N., Trimmer J.S. (2001). Subunit composition and novel localization of K+ channels in spinal cord. J. Comp. Neurol. 429: 166—176. PMID 11086297 DOI:10.1002/1096-9861(20000101)429:1<166::AID-CNE13>3.0.CO;2-Y

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6229 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13303 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані