KCNN1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNN1, KCa2.1, SK1, SKCA1, hSK1, potassium calcium-activated channel subfamily N member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602982 MGI: 1933993 HomoloGene: 37595 GeneCards: KCNN1 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
bicuculline, tetraethylammonium, tubocurarine[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • small conductance calcium-activated potassium channel activity • calcium-activated potassium channel activity • calmodulin binding • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • voltage-gated potassium channel complex • neuronal cell body • клітинна мембрана • мембрана • neuron projection |
---|
Біологічний процес | • potassium ion transport • ion transport • potassium ion transmembrane transport • chemical synaptic transmission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | | NP_115773 NP_001350336 NP_001350337 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 17.95 – 18 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNN1 (англ. Potassium calcium-activated channel subfamily N member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 59 987[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNSHSYNGSV | | GRPLGSGPGA | | LGRDPPDPEA | | GHPPQPPHSP | | GLQVVVAKSE |
PARPSPGSPR | | GQPQDQDDDE | | DDEEDEAGRQ | | RASGKPSNVG | | HRLGHRRALF |
EKRKRLSDYA | | LIFGMFGIVV | | MVTETELSWG | | VYTKESLYSF | | ALKCLISLST |
AILLGLVVLY | | HAREIQLFMV | | DNGADDWRIA | | MTCERVFLIS | | LELAVCAIHP |
VPGHYRFTWT | | ARLAFTYAPS | | VAEADVDVLL | | SIPMFLRLYL | | LGRVMLLHSK |
IFTDASSRSI | | GALNKITFNT | | RFVMKTLMTI | | CPGTVLLVFS | | ISSWIIAAWT |
VRVCERYHDK | | QEVTSNFLGA | | MWLISITFLS | | IGYGDMVPHT | | YCGKGVCLLT |
GIMGAGCTAL | | VVAVVARKLE | | LTKAEKHVHN | | FMMDTQLTKR | | VKNAAANVLR |
ETWLIYKHTR | | LVKKPDQARV | | RKHQRKFLQA | | IHQAQKLRSV | | KIEQGKLNDQ |
ANTLTDLAKT | | QTVMYDLVSE | | LHAQHEELEA | | RLATLESRLD | | ALGASLQALP |
GLIAQAIRPP | | PPPLPPRPGP | | GPQDQAARSS | | PCRWTPVAPS | | DCG |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Litt M., LaMorticella D., Bond C.T., Adelman J.P. (1999). Gene structure and chromosome mapping of the human small-conductance calcium-activated potassium channel SK1 gene (KCNN1). Cytogenet. Cell Genet. 86: 70—73. PMID 10516439
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium calcium-activated channel subfamily N member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6290 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92952 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|