TRPC4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRPC4, HTRP-4, HTRP4, TRP4, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603651 MGI: 109525 HomoloGene: 22955 GeneCards: TRPC4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
2-aminoethoxydiphenylborate[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • beta-catenin binding • store-operated calcium channel activity • cadherin binding • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • Кальцієві канали • мембрана • cell-cell junction • cortical cytoskeleton • клітинна мембрана • cell surface • basolateral plasma membrane • caveola • membrane raft • integral component of plasma membrane • GO:0009327 protein-containing complex • cation channel complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion import • oligodendrocyte differentiation • ion transport • calcium ion transmembrane transport • manganese ion transport • gamma-aminobutyric acid secretion • calcium ion transport • трансмембранний транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001135955 NM_001135956 NM_001135957 NM_001135958 NM_003306
| NM_016179 NM_001354799 NM_001354806 NM_001372055 |
| | NM_001253682 NM_001253683 NM_016984 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001129427 NP_001129428 NP_001129429 NP_001129430 NP_003297
| NP_057263 NP_001341728 NP_001341735 NP_001358984 |
| | NP_001240611 NP_001240612 NP_058680 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 37.63 – 37.87 Mb | Хр. 3: 54.06 – 54.23 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRPC4 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 112 101[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAQFYYKRNV | | NAPYRDRIPL | | RIVRAESELS | | PSEKAYLNAV | | EKGDYASVKK |
SLEEAEIYFK | | ININCIDPLG | | RTALLIAIEN | | ENLELIELLL | | SFNVYVGDAL |
LHAIRKEVVG | | AVELLLNHKK | | PSGEKQVPPI | | LLDKQFSEFT | | PDITPIILAA |
HTNNYEIIKL | | LVQKGVSVPR | | PHEVRCNCVE | | CVSSSDVDSL | | RHSRSRLNIY |
KALASPSLIA | | LSSEDPFLTA | | FQLSWELQEL | | SKVENEFKSE | | YEELSRQCKQ |
FAKDLLDQTR | | SSRELEIILN | | YRDDNSLIEE | | QSGNDLARLK | | LAIKYRQKEF |
VAQPNCQQLL | | ASRWYDEFPG | | WRRRHWAVKM | | VTCFIIGLLF | | PVFSVCYLIA |
PKSPLGLFIR | | KPFIKFICHT | | ASYLTFLFLL | | LLASQHIDRS | | DLNRQGPPPT |
IVEWMILPWV | | LGFIWGEIKQ | | MWDGGLQDYI | | HDWWNLMDFV | | MNSLYLATIS |
LKIVAFVKYS | | ALNPRESWDM | | WHPTLVAEAL | | FAIANIFSSL | | RLISLFTANS |
HLGPLQISLG | | RMLLDILKFL | | FIYCLVLLAF | | ANGLNQLYFY | | YEETKGLTCK |
GIRCEKQNNA | | FSTLFETLQS | | LFWSIFGLIN | | LYVTNVKAQH | | EFTEFVGATM |
FGTYNVISLV | | VLLNMLIAMM | | NNSYQLIADH | | ADIEWKFART | | KLWMSYFEEG |
GTLPTPFNVI | | PSPKSLWYLI | | KWIWTHLCKK | | KMRRKPESFG | | TIGRRAADNL |
RRHHQYQEVM | | RNLVKRYVAA | | MIRDAKTEEG | | LTEENFKELK | | QDISSFRFEV |
LGLLRGSKLS | | TIQSANASKE | | SSNSADSDEK | | SDSEGNSKDK | | KKNFSLFDLT |
TLIHPRSAAI | | ASERHNISNG | | SALVVQEPPR | | EKQRKVNFVT | | DIKNFGLFHR |
RSKQNAAEQN | | ANQIFSVSEE | | VARQQAAGPL | | ERNIQLESRG | | LASRGDLSIP |
GLSEQCVLVD | | HRERNTDTLG | | LQVGKRVCPF | | KSEKVVVEDT | | VPIIPKEKHA |
KEEDSSIDYD | | LNLPDTVTHE | | DYVTTRL |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Mery L., Magnino F., Schmidt K., Krause K.-H., Dufour J.-F. (2001). Alternative splice variants of hTrp4 differentially interact with the C-terminal portion of the inositol 1,4,5-trisphosphate receptors. FEBS Lett. 487: 377—383. PMID 11163362 DOI:10.1016/S0014-5793(00)02362-0
- Schaefer M., Plant T.D., Stresow N., Albrecht N., Schultz G. (2002). Functional differences between TRPC4 splice variants. J. Biol. Chem. 277: 3752—3759. PMID 11713258 DOI:10.1074/jbc.M109850200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
- Odell A.F., Scott J.L., Van Helden D.F. (2005). Epidermal growth factor induces tyrosine phosphorylation, membrane insertion, and activation of transient receptor potential channel 4. J. Biol. Chem. 280: 37974—37987. PMID 16144838 DOI:10.1074/jbc.M503646200
- Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPC4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12336 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBN4 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
Ліганд-залежні | |
---|
Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
|
|
---|
постійно відчинені | |
---|
Протончутливі | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
K+: Калієві канали |
---|
Кальцій-активовані | |
---|
Вхідного випрямлення | |
---|
Двопородоменні | |
---|
Потенціалкеровані | |
---|
|
|
|
|