CEBPA |
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識別號 |
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别名 | CEBPA;, C/EBP-alpha, CEBP, CCAAT/enhancer binding protein alpha, CCAAT enhancer binding protein alpha |
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外部ID | OMIM:116897 MGI:99480 HomoloGene:3211 GeneCards:CEBPA |
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相關疾病 |
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急性骨髓性白血病[1] |
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基因位置(小鼠) |
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| 染色体 | 小鼠7号染色体[3] |
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| 基因座 | 7 B2|7 21.02 cM | 起始 | 34,818,718 bp[3] |
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终止 | 34,821,353 bp[3] |
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基因本體 |
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分子功能 | • DNA结合 • sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA结合转录因子活性 • 转录共激活因子活性 • 转录因子结合 • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • 激酶结合 • 血浆蛋白结合 • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
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細胞組分 | • 轉錄調節複合物 • RNA polymerase II transcription regulator complex • 核仁 • 细胞核 • 核质 • 細胞內膜結合細胞器
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生物學過程 | • Notch信号通路 • transcription by RNA polymerase I • myeloid cell differentiation • regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to lithium ion • glucose homeostasis • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • lung development • cytokine-mediated signaling pathway • 尿素循环 • regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to organic cyclic compound • mitochondrion organization • embryonic placenta development • cholesterol metabolic process • negative regulation of cell cycle • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cell maturation • generation of precursor metabolites and energy • transcription, DNA-templated • macrophage differentiation • multicellular organism development • positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of osteoblast differentiation • granulocyte differentiation • regulation of cell population proliferation • brown fat cell differentiation • lipid homeostasis • white fat cell differentiation • 内耳的发生 • liver development • viral process • negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • positive regulation of transcription by RNA polymerase III • fat cell differentiation • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of DNA-templated transcription, initiation • positive regulation of macrophage activation • positive regulation of inflammatory response • interleukin-6-mediated signaling pathway
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Sources:Amigo / QuickGO |
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直系同源 |
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物種 | 人類 | 小鼠 |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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mRNA序列 | |
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NM_004364 NM_001285829 NM_001287424 NM_001287435 |
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NM_001287514 NM_001287515 NM_001287521 NM_001287523 NM_007678 |
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蛋白序列 | |
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NP_001272758 NP_001274353 NP_001274364 NP_004355 |
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NP_001274443 NP_001274444 NP_001274450 NP_001274452 NP_031704 |
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基因位置(UCSC) | Chr 19: 33.3 – 33.3 Mb | Chr 7: 34.82 – 34.82 Mb |
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PubMed查找 | [4] | [5] |
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維基數據 |
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CCAAT/增强子结合蛋白α,简称C/EBP-α或CEBPA是一种由人类CEBPA基因编码的蛋白质。[6][7]CEBPA是参与某些血细胞分化的转录因子。[8]有关基因增强子中的CCAAT结构基序和CCAAT/增强子结合蛋白的详细信息,请参见特定页面。
功能
这种无内含子基因编码的蛋白质是一种bZIP转录因子,它可以作为同源二聚体与某些启动子和基因增强子结合。它还可以与相关蛋白C/EBP-β和C/EBP-γ以及不同的转录因子如c-Jun形成异二聚体。编码的蛋白质是脂肪细胞生成和这些细胞中脂质积累以及肝脏中葡萄糖和脂质代谢的关键调节因子。[9]该蛋白质已被证明与启动子结合并调节编码瘦蛋白的基因的表达,瘦蛋白是一种在体重稳态中起重要作用的蛋白质。此外,编码的蛋白质可以与CDK2和CDK4相互作用,从而抑制这些激酶并导致培养的细胞停止分裂。[10]此外,CEBPA对骨髓谱系定型至关重要,因此对于正常成熟粒细胞的形成和异常急性骨髓性白血病的发展都是必需的。[11]
常见突变
CEBPA突变可分为两大类。一类突变通过改变其COOH末端碱性亮氨酸拉链结构域来阻止CEBPA的DNA结合。另一类突变破坏了CEBPA的NH2末端的翻译。 CEBPA突变导致CEBPA活性降低,有助于骨髓前体的转化。[12]
相互作用
CEBPA已被证明与周期蛋白依赖性激酶2相互作用[13]和周期蛋白依赖性激酶4。[13]
临床意义
CEBPA的突变已被证明与成人和儿童急性骨髓性白血病患者的良好结果有关。[14]
在急性骨髓性白血病中的意义
急性骨髓性白血病的特征在于造血祖细胞的遗传异常。这包括原始细胞的过度增殖,以及阻止粒细胞的造血。已经表明,抑制CEBPA表达和阻断CEBPA会阻止骨髓祖细胞的分化。出于这个原因,CEBPA在粒细胞分化过程中的作用和CEBPA作为肿瘤抑制基因的作用在急性髓细胞白血病的预后中至关重要。[15]
CEBPA突变的预后意义
CEBPA在未成熟粒细胞的分化中非常重要。CEBPA基因的突变已被证明在急性骨髓性白血病患者的白血病发生和预后中起关键作用。在最近的研究中,在7%到15%的急性骨髓性白血病患者中发现了CEBPA突变。在这些急性骨髓性白血病患者中看到的三种不同类型的突变包括种系N末端突变、N末端框移突变和C末端突变。这些突变最常见于急性骨髓性白血病M1或M2。许多报道将CEBPA突变与急性骨髓细胞白血病的良好结果联系起来。这是因为这些突变可能会导致这些患者的分化停滞。有CEBPA突变的患者比没有突变的患者有更长的缓解持续时间和生存时间。[12]因此,CEBPA突变的存在与疾病进展的更有利过程直接相关。[16]
在实体瘤中的意义
最近显示,CEBPA远端启动子区域的表观遗传修饰导致胰腺癌细胞、肺癌和头颈部鳞状细胞癌中CEBPA表达下调。[17][18]
CEBPA的甲基化作为急性骨髓性白血病患者的预后生物标记
最近的一项研究发现,较高水平的CEBPA甲基化与治疗反应成正比。完全反应率与CEBPA甲基化水平成比例增加。出于这个原因,有人提出CEBPA的甲基化可能是急性髓细胞白血病预后中非常有用的生物标记。[19]
参考文献
- ^ 與CEBPA相關的疾病;在維基數據上查看/編輯參考.
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阅读
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外部链接
- Human CEBPA genome location and CEBPA gene details page in the UCSC Genome Browser(英语:UCSC Genome Browser).
- GeneReviews/NIH/NCBI/UW entry on Familial Acute Myeloid Leukemia (AML) with Mutated CEBPA (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- 醫學主題詞表(MeSH):CEBPA+protein,+human
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(1) 碱性结构域 |
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(1.1)碱性亮氨酸拉链
(bZIP(英语:bZIP domain)) | 转录激活因子(英语:Activating transcription factor)( AATF(英语:Apoptosis-antagonizing transcription factor)、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP(α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
| ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(英语:Myogenic regulatory factors)(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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(1.3)bHLH-ZIP(英语:Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors) | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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(1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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(1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋(英语:Basic helix-span-helix)
(bHSH) | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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(2.1) 核受体(Cys4) | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α(英语:Peroxisome proliferator-activated receptor alpha)、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2(英语:V-erbA-related gene)、 HNF4(英语:Hepatocyte nuclear factor 4)(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素(英语:Steroid hormone receptor)( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(英语:Estrogen related receptor)(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(英语:Nur (biology))(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF(英语:Germ cell nuclear factor) · 第零亚族DAX1、 SHP(英语:Small heterodimer partner) |
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(2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(英语:GATA transcription factor)(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1(英语:Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1) |
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(2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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(2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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(2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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(2.6)WRKY结构 | WRKY转录因子家族(英语:WRKY transcription factor family) |
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(3.1)同源异型域 | ARX(英语:Aristaless related homeobox) · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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(3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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(3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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(3.4)热休克因子(英语:Heat Shock Factor) | HSF(1、2、4) |
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(3.5)色氨酸簇(英语:Tryptophan clusters) | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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(3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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| (4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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(4.1) Rel homology region(英语:Rel homology domain) | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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(4.2) STAT | |
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(4.3) p53样转录因子 | |
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(4.4) MADS盒 | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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(4.6) TATA结合蛋白 | |
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(4.7) 高迁移率族 | BBX(英语:BBX (gene)) · HMGB( 1(英语:HMGB1)、 2(英语:HMGB2)、 3(英语:HMGB3)、 4(英语:HMGB4)) · HMGN(英语:HMGN)、( 1(英语:HMGN1)、 2(英语:HMGN2)、 3(英语:HMGN3)、 4(英语:HMGN4)) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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(4.9) Grainyhead(英语:Grainyhead) | TFCP2 |
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(4.10) 冷休克域(英语:Cold-shock domain) | CSDA、YBX1 |
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(4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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| (0) 其他转录因子 |
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(0.2) HMGI(Y) | |
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(0.3) 袋状结构域 | Rb · RBL1(英语:Retinoblastoma-like protein 1) · RBL2(英语:Retinoblastoma-like protein 2) |
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(0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP(英语:Ethylene-responsive element binding protein) · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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(0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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| 参见 转录因子/共调节因子缺陷(英语:Template:Transcription factor/coregulator deficiencies) Category:蛋白质生物合成模板 |
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