TATA结合蛋白

TATA结合蛋白
已知的結構
PDB直系同源搜索: PDBe RCSB
PDBID列表

1TGH、​1C9B、​1JFI、​1NVP、​4ROC、​4ROE、​4ROD、​5IY9、​5IYA、​5FUR、​5IYC、​5IYB、​5IY7、​5IY8、​5IYD、​5IY6

識別號
别名TBP；, GTF2D, GTF2D1, HDL4, SCA17, TFIID, TATA-box binding protein, TATA-binding protein, TBP1
外部IDOMIM：600075 MGI：101838 HomoloGene：2404 GeneCards：TBP
相關疾病
spinocerebellar ataxia type 17[1]
基因位置（人类）
6號染色體
染色体6號染色體[2]
6號染色體
TATA结合蛋白的基因位置
TATA结合蛋白的基因位置
基因座6q27起始170,554,302 bp[2]
终止170,572,870 bp[2]
基因位置（小鼠）
小鼠17号染色体
染色体小鼠17号染色体[3]
小鼠17号染色体
TATA结合蛋白的基因位置
TATA结合蛋白的基因位置
基因座17 A2|17 8.95 cM起始15,720,150 bp[3]
终止15,748,641 bp[3]
RNA表达模式
查阅更多表达数据
基因本體
分子功能• DNA结合
• DNA结合转录因子活性
• 转录因子结合
• RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
• 血浆蛋白结合
• 酶结合
• TFIIB-class transcription factor binding
• aryl hydrocarbon receptor binding
• 核心启动子近端区域序列特异性DNA结合
• DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
• RNA polymerase III general transcription initiation factor activity
• RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
• RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
• RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
細胞組分• 細胞質
• transcription factor TFIID complex
• male pronucleus
• 雌原核
• 核质
• transcription factor TFIIA complex
• pronucleus
• 细胞核
• transcription preinitiation complex
• 大分子复合体
• transcription factor TFIIIB complex
• 轉錄調節複合物
生物學過程• termination of RNA polymerase I transcription
• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation
• regulation of transcription, DNA-templated
• transcription initiation from RNA polymerase I promoter
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• 精子发生
• DNA-templated transcription, initiation
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• snRNA transcription by RNA polymerase II
• regulation of signal transduction by p53 class mediator
• viral process
• regulation of transcription by RNA polymerase III
• transcription by RNA polymerase II
• transcription by RNA polymerase III
• RNA polymerase II preinitiation complex assembly
• regulation of transcription by RNA polymerase II
• RNA polymerase III preinitiation complex assembly
• transcription elongation from RNA polymerase I promoter
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

6908

21374

Ensembl

ENSG00000112592

ENSMUSG00000014767

UniProt

P20226

P29037

mRNA​序列

NM_003194
​NM_001172085

NM_013684

蛋白序列

NP_001165556
​NP_003185

NP_038712

基因位置​（UCSC）Chr 6: 170.55 – 170.57 MbChr 17: 15.72 – 15.75 Mb
PubMed​查找[4][5]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠
TBP
crystal structure of a yeast brf1-tbp-dna ternary complex
鑑定
標誌TBP
PfamPF00352（旧版）
Pfam宗系CL0407（旧版）
InterPro（英语：InterPro）IPR000814
PROSITE（英语：PROSITE）PDOC00303
SCOP（英语：Structural Classification of Proteins）1tbp / SUPFAM
現有可用的蛋白結構：
Pfam結構（旧版） / ECOD
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum（英语：PDBsum）結構概要

TATA结合蛋白质（英語：TATA-binding protein，TBP）是一种通用转录因子，具体结合于DNA序列上的TATA盒。TATA盒位于真核基因的转录起始位点上游约25个bp，属于啟動子区[6]。TBP可以和各个TBP相关因子共同组成通用转录因子TFIID,再进一步组成RNA聚合酶Ⅱ的转录起始复合物[7]。

蛋白质的相互作用

TATA结合蛋白与下列蛋白質进行互作：

参考文献

  1. ^ 與TATA结合蛋白相關的疾病；在維基數據上查看/編輯參考. 
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外部链接

  • 查
  • 论
  • 编
 
（1） 碱性结构域
（1.1）碱性亮氨酸拉链
（bZIP（英语：bZIP domain））
转录激活因子（英语：Activating transcription factor）（AATF（英语：Apoptosis-antagonizing transcription factor）、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 ·
C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF（B、F、G、K） ·
NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1
（1.2）碱性螺旋-环-螺旋
（bHLH）
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） ·
HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins（1、2、3 ·
肌形成调节因子（英语：Myogenic regulatory factors）（MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 ·
Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1
（1.3）bHLH-ZIP（英语：Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors）
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）
（1.4） NF-1
NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）
（1.5） RF-X
RFX（1、2、3、4、5、ANK）
（1.6）碱性螺旋-跨-螺旋（英语：Basic helix-span-helix）
（bHSH）
AP-2（α、β、γ、δ、ε）
 
（2） 锌指结构DNA作用区域
（2.1） 核受体（Cys4）
第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α（英语：Peroxisome proliferator-activated receptor alpha）、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、
Rev-ErbA（α、β）、VDR
第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2（英语：V-erbA-related gene）、HNF4（英语：Hepatocyte nuclear factor 4）（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）
第三亚族（甾类激素（英语：Steroid hormone receptor）（雄激素、雌激素（α、β）、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮）、雌激素相关（英语：Estrogen related receptor）（α、β、γ））
第四亚族NUR（英语：Nur (biology)）（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF（英语：Germ cell nuclear factor） · 第零亚族DAX1、SHP（英语：Small heterodimer partner）
（2.2） 其他的Cys4结构
GATA（英语：GATA transcription factor）（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1（英语：Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1）
（2.3） Cys2His2
通用转录因子（TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF（1、2）、TFⅡH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2））
ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（1、2、3、4） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） ·
HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · Sp/KLF家族（KLF：1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17，SP：1、2、4、7、8） · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655）
（2.4） Cys6
HIVEP1
（2.5）交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B
（2.6）WRKY结构
WRKY转录因子家族（英语：WRKY transcription factor family）
 
（3）螺旋-转角-螺旋结构域
ARX（英语：Aristaless related homeobox） · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2）  · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU结构域（PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子：1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）
（3.2）配对框
PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）
（3.3）叉头状/翼状螺旋
E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）
（3.4）热休克因子（英语：Heat Shock Factor）
HSF（1、2、4）
（3.5）色氨酸簇（英语：Tryptophan clusters）
ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2
（3.6）TEA结构域
transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）
 
（4） 具有小凹槽触点的β-支架因子
（4.1） Rel homology region（英语：Rel homology domain）
NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）
（4.2） STAT
STAT（1、2、3、4、5、6）
（4.3） p53样转录因子
p53 p63 p73家族（p53 · p63 · p73） · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）
（4.4） MADS盒
Mef2（A、B、C、D） · SRF
（4.6） TATA结合蛋白
TATA结合蛋白 · TBPL1
（4.7） 高迁移率族
BBX（英语：BBX (gene)） · HMGB（1（英语：HMGB1）、2（英语：HMGB2）、3（英语：HMGB3）、4（英语：HMGB4）） · HMGN（英语：HMGN）、（1（英语：HMGN1）、2（英语：HMGN2）、3（英语：HMGN3）、4（英语：HMGN4）） · HNF（1A、1B） · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY） · SSRP1 ·
TCF/LEF家族（TCF（1、3、4） · LEF1) · TOX（1、2、3、4）
（4.9） Grainyhead（英语：Grainyhead）
TFCP2
（4.10） 冷休克域（英语：Cold-shock domain）
CSDA、YBX1
（4.11） Runt
CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）
 
（0） 其他转录因子
（0.2） HMGI（Y）
HMGA（1、2） · HBP1
（0.3） 袋状结构域
Rb · RBL1（英语：Retinoblastoma-like protein 1） · RBL2（英语：Retinoblastoma-like protein 2）
（0.5） AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP（英语：Ethylene-responsive element binding protein） · B3(ARF · ABI3 · RAV)
（0.6） Miscellaneous
ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷（英语：Template:Transcription factor/coregulator deficiencies）
Category:蛋白质生物合成模板