CEBPD |
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識別號 |
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别名 | CEBPD;, C/EBP-delta, CELF, CRP3, NF-IL6-beta, CCAAT/enhancer binding protein delta, CCAAT enhancer binding protein delta |
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外部ID | OMIM:116898 MGI:103573 HomoloGene:3808 GeneCards:CEBPD |
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基因位置(人类) |
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| 染色体 | 8號染色體[1] |
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| 基因座 | 8q11.21 | 起始 | 47,736,913 bp[1] |
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终止 | 47,738,164 bp[1] |
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基因位置(小鼠) |
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| 染色体 | 小鼠16号染色体[2] |
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| 基因座 | 16 A2|16 10.09 cM | 起始 | 15,705,150 bp[2] |
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终止 | 15,708,895 bp[2] |
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基因本體 |
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分子功能 | • DNA结合转录因子活性 • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA结合 • sequence-specific DNA binding • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • 血浆蛋白结合 • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity
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細胞組分 | • 细胞核 • 核质
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生物學過程 | • regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • hematopoietic progenitor cell differentiation • regulation of transcription by RNA polymerase II • fat cell differentiation • positive regulation of osteoblast differentiation • negative regulation of transcription, DNA-templated • 内耳的发生
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Sources:Amigo / QuickGO |
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直系同源 |
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物種 | 人類 | 小鼠 |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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mRNA序列 | | |
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蛋白序列 | | |
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基因位置(UCSC) | Chr 8: 47.74 – 47.74 Mb | Chr 16: 15.71 – 15.71 Mb |
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PubMed查找 | [3] | [4] |
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維基數據 |
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CCAAT/增强子结合蛋白δ,简称C/EBP-δ或CEBPD,是一种在人类中由CEBPD基因编码的蛋白质。[5][6]
功能
由这种无内含子基因编码的蛋白质是一种bZIP转录因子,它可以作为同源二聚体与某些DNA调节区结合。它还可以与相关蛋白C/EBP-α形成异二聚体。编码的蛋白质在调节参与免疫和炎症反应的基因中很重要,并且可能参与调节与巨噬细胞活化和/或分化相关的基因。[7]
CEBPD参与细胞凋亡和细胞增殖的调节。它可能充当肿瘤抑制因子。[8]
一项针对小鼠的研究表明,CEBPD在慢性阻塞性肾病进展过程中可防止肾小管损伤和肾小管间质纤维化的发展。[9]
CEBPD基因的功能可以通过基于独立验证的siRNA敲低来有效检查。[10]
相互作用
CEBPD已被证明能与SMAD3相互作用。[11]
参见
参考文献
- ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000221869 - Ensembl, May 2017
- ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000071637 - Ensembl, May 2017
- ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
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- ^ Duitman J, Borensztajn KS, Pulskens WP, Leemans JC, Florquin S, Spek CA. CCAAT-enhancer binding protein delta (C/EBPδ) attenuates tubular injury and tubulointerstitial fibrogenesis during chronic obstructive nephropathy. Laboratory Investigation; A Journal of Technical Methods and Pathology. Jan 2014, 94 (1): 89–97. PMID 24247561. doi:10.1038/labinvest.2013.127 .
- ^ Munkácsy, Gyöngyi; Sztupinszki, Zsófia; Herman, Péter; Bán, Bence; Pénzváltó, Zsófia; Szarvas, Nóra; Győrffy, Balázs. Validation of RNAi Silencing Efficiency Using Gene Array Data shows 18.5% Failure Rate across 429 Independent Experiments. Molecular Therapy: Nucleic Acids. 2016, 5 (9): e366. ISSN 2162-2531. PMC 5056990 . PMID 27673562. doi:10.1038/mtna.2016.66 (英语).
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阅读
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- Kinoshita S, Akira S, Kishimoto T. A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb 1992, 89 (4): 1473–6. Bibcode:1992PNAS...89.1473K. PMC 48473 . PMID 1741402. doi:10.1073/pnas.89.4.1473 .
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外部链接
- Human CEBPD genome location and CEBPD gene details page in the UCSC Genome Browser(英语:UCSC Genome Browser).
- 醫學主題詞表(MeSH):CEBPD+protein,+human
(1) 碱性结构域 |
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(1.1)碱性亮氨酸拉链
(bZIP(英语:bZIP domain)) | 转录激活因子(英语:Activating transcription factor)( AATF(英语:Apoptosis-antagonizing transcription factor)、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
| ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(英语:Myogenic regulatory factors)(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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(1.3)bHLH-ZIP(英语:Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors) | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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(1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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(1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋(英语:Basic helix-span-helix)
(bHSH) | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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(2.1) 核受体(Cys4) | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α(英语:Peroxisome proliferator-activated receptor alpha)、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2(英语:V-erbA-related gene)、 HNF4(英语:Hepatocyte nuclear factor 4)(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素(英语:Steroid hormone receptor)( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(英语:Estrogen related receptor)(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(英语:Nur (biology))(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF(英语:Germ cell nuclear factor) · 第零亚族DAX1、 SHP(英语:Small heterodimer partner) |
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(2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(英语:GATA transcription factor)(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1(英语:Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1) |
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(2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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(2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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(2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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(2.6)WRKY结构 | WRKY转录因子家族(英语:WRKY transcription factor family) |
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(3.1)同源异型域 | ARX(英语:Aristaless related homeobox) · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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(3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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(3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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(3.4)热休克因子(英语:Heat Shock Factor) | HSF(1、2、4) |
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(3.5)色氨酸簇(英语:Tryptophan clusters) | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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(3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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(4.1) Rel homology region(英语:Rel homology domain) | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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(4.2) STAT | |
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(4.3) p53样转录因子 | |
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(4.4) MADS盒 | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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(4.6) TATA结合蛋白 | |
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(4.7) 高迁移率族 | BBX(英语:BBX (gene)) · HMGB( 1(英语:HMGB1)、 2(英语:HMGB2)、 3(英语:HMGB3)、 4(英语:HMGB4)) · HMGN(英语:HMGN)、( 1(英语:HMGN1)、 2(英语:HMGN2)、 3(英语:HMGN3)、 4(英语:HMGN4)) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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(4.9) Grainyhead(英语:Grainyhead) | TFCP2 |
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(4.10) 冷休克域(英语:Cold-shock domain) | CSDA、YBX1 |
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(4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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(0) 其他转录因子 |
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(0.2) HMGI(Y) | |
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(0.3) 袋状结构域 | Rb · RBL1(英语:Retinoblastoma-like protein 1) · RBL2(英语:Retinoblastoma-like protein 2) |
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(0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP(英语:Ethylene-responsive element binding protein) · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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(0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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参见 转录因子/共调节因子缺陷(英语:Template:Transcription factor/coregulator deficiencies) Category:蛋白质生物合成模板 |