E2F是一组编码高等真核生物转录因子家族的基因。其中三个是激活剂:E2F1,E2F2和E2F3a。其他六个充当抑制剂:E2F3b,E2F4,E2F5,E2F6,E2F7a,E2F7b和E2F8。它们都参与哺乳动物细胞中DNA的细胞周期调控和合成。E2F作为转录因子与目标启动子序列中的 TTTCCCGC共有结合位点结合,TTTCCCGC并不是固定序列,可能存在轻微变化。
E2F转录因子家族
E2F 家族成员的氨基酸序列示意图(左侧为N-端,右侧为C-端)突出显示每个成员中功能域的相对位置:
家族成员 | 文字说明 |
| - cyc A -周期蛋白A(英语:Cyclin A)结合结构域
- DNA - DNA结合结构域(英语:DNA-binding domain)
- DP1,2 - 与DP1、2进行二聚化的结构域
- TA - 转录激活结构域
- PB - 口袋状蛋白结合结构域
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基因
转录因子E2F由人类E2F1基因编码
结构
X 射线晶体学分析表明,E2F 转录因子家族具有类似于翼螺旋DNA 结合基序的折叠。 [1]
参考文献
- ^ Structural basis of DNA recognition by the heterodimeric cell cycle transcription factor E2F-DP. Genes & Development. March 1999, 13 (6): 666–74. PMC 316551 . PMID 10090723. doi:10.1101/gad.13.6.666.
外部链接
- 醫學主題詞表(MeSH):E2F+Transcription+Factors
- Drosophila E2F transcription factor - The Interactive Fly (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- Drosophila E2F transcription factor 2 - The Interactive Fly (页面存档备份,存于互联网档案馆)
(1) 碱性结构域 |
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(1.1)碱性亮氨酸拉链
(bZIP(英语:bZIP domain)) | 转录激活因子(英语:Activating transcription factor)( AATF(英语:Apoptosis-antagonizing transcription factor)、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
| ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(英语:Myogenic regulatory factors)(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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(1.3)bHLH-ZIP(英语:Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors) | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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(1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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(1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋(英语:Basic helix-span-helix)
(bHSH) | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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(2.1) 核受体(Cys4) | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α(英语:Peroxisome proliferator-activated receptor alpha)、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2(英语:V-erbA-related gene)、 HNF4(英语:Hepatocyte nuclear factor 4)(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素(英语:Steroid hormone receptor)( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(英语:Estrogen related receptor)(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(英语:Nur (biology))(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF(英语:Germ cell nuclear factor) · 第零亚族DAX1、 SHP(英语:Small heterodimer partner) |
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(2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(英语:GATA transcription factor)(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1(英语:Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1) |
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(2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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(2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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(2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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(2.6)WRKY结构 | WRKY转录因子家族(英语:WRKY transcription factor family) |
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(3.1)同源异型域 | ARX(英语:Aristaless related homeobox) · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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(3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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(3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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(3.4)热休克因子(英语:Heat Shock Factor) | HSF(1、2、4) |
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(3.5)色氨酸簇(英语:Tryptophan clusters) | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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(3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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(4.1) Rel homology region(英语:Rel homology domain) | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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(4.2) STAT | |
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(4.3) p53样转录因子 | |
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(4.4) MADS盒 | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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(4.6) TATA结合蛋白 | |
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(4.7) 高迁移率族 | BBX(英语:BBX (gene)) · HMGB( 1(英语:HMGB1)、 2(英语:HMGB2)、 3(英语:HMGB3)、 4(英语:HMGB4)) · HMGN(英语:HMGN)、( 1(英语:HMGN1)、 2(英语:HMGN2)、 3(英语:HMGN3)、 4(英语:HMGN4)) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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(4.9) Grainyhead(英语:Grainyhead) | TFCP2 |
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(4.10) 冷休克域(英语:Cold-shock domain) | CSDA、YBX1 |
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(4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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(0) 其他转录因子 |
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(0.2) HMGI(Y) | |
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(0.3) 袋状结构域 | Rb · RBL1(英语:Retinoblastoma-like protein 1) · RBL2(英语:Retinoblastoma-like protein 2) |
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(0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP(英语:Ethylene-responsive element binding protein) · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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(0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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参见 转录因子/共调节因子缺陷(英语:Template:Transcription factor/coregulator deficiencies) Category:蛋白质生物合成模板 |
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週期素 | - A(A1、A2)
- B(B1、B2、B3)
- D(D1、D2、D3)
- E(E1、E2)
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CDK | - 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- z
- 9
- 10
- 周期蛋白依赖性激酶激活激酶(英语:CDK-activating kinase)
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CDK抑制因子(英语:Cyclin-dependent kinase inhibitor protein) | |
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P53 p63 p73家族 | |
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其他 | - Cdc2
- Cdc25(英语:Cdc25)
- Cdc42(英语:CDC42)
- 细胞凋亡易感蛋白(英语:Cellular apoptosis susceptibility protein)
- E2F
- 促成熟因子(英语:Maturation promoting factor)
- Wee
- Cullin
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期与 检查点 | 間期 | |
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M期 | - 有絲分裂
- 早前期
- 前期
- 前中期(英语:Prometaphase)
- 中期(英语:Metaphase)
- 后期(英语:Anaphase)
- 末期(英语:Telophase)
- 胞质分裂(英语:Cytokinesis)
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細胞週期檢查點 | - 限制点(英语:Restriction point)
- 纺锤体检查点(英语:Spindle checkpoint)
- 复制后检查点(英语:Postreplication checkpoint)
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其他细胞期 | |
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参见:蛋白质生物合成导航 |
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