COL28A1

COL28A1
Ідентифікатори
Символи COL28A1, COL28, collagen type XXVIII alpha 1, collagen type XXVIII alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 609996 MGI: 2685312 HomoloGene: 66345 GeneCards: COL28A1
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• peptidase inhibitor activity
• serine-type endopeptidase inhibitor activity
• extracellular matrix structural constituent
• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength

Клітинна компонента

• extracellular region
• базальна мембрана
• Колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• міжклітинний простір
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• negative regulation of peptidase activity
• адгезія клітин
• negative regulation of endopeptidase activity
• extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
340267
213945
Ensembl
ENSG00000215018
ENSMUSG00000068794
UniProt
Q2UY09
Q2UY11
RefSeq (мРНК)
NM_001037763
NM_001037865
RefSeq (білок)
NP_001032852
NP_001032954
Локус (UCSC) Хр. 7: 7.36 – 7.54 Mb Хр. 6: 8 – 8.19 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL28A1 (англ. Collagen type XXVIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 125 амінокислот, а молекулярна маса — 116 657[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MWNRYFVFYLLLLSAFTSQTVSGQRKKGPKSNLLARKSDVQGSICFIDIV
FIVDSSESSKIALFDKQKDFVDSLSDKIFQLTPGRSLEYDIKLAALQFSS
SVQIDPPFSSWKDLQTFKQKVKSMNLIGQGTFSYYAISNATRLLKREGRK
DGVKVVLLMTDGIDHPKNPDVQSISEDARISGISFITIALSTVVNEAKLR
LISGDSSSEPTLLLSDPTLVDKIQDRLDILFEKKCERKICECEKGDPGDP
GPPGTHGNPGIKGERGPKGNPGNAQKGEAGERGPGGIPGYKGDKGERGEC
GKPGIKGDKGSPGPYGPKGPRGIQGITGPPGDPGPKGFQGNKGEPGPPGP
YGSPGAPGIGQQGIKGERGQEGRPGAPGPIGVGEPGQPGPRGPEGVPGER
GLPGEGFPGPKGEKGSEGPTGPQGLQGLSIKGEKGDIGPVGPQGPMGIPG
IGSQGEQGIQGPIGPPGPQGPAGQGLPGSKGEVGQMGPTGPRGPVGIGVQ
GPKGEPGSIGLPGQPGVPGEDGAAGKKGEAGLPGARGPEGPPGKGQPGPK
GDEGKKGSKGNQGQRGLPGPEGPKGEPGIMGPFGMPGTSIPGPPGPKGDR
GGPGIPGFKGEPGLSIRGPKGVQGPRGPVGAPGLKGDGYPGVPGPRGLPG
PPGPMGLRGVGDTGAKGEPGVRGPPGPSGPRGVGTQGPKGDTGQKGLPGP
PGPPGYGSQGIKGEQGPQGFPGPKGTMGHGLPGQKGEHGERGDVGKKGDK
GEIGEPGSPGKQGLQGPKGDLGLTKEEIIKLITEICGCGPKCKETPLELV
FVIDSSESVGPENFQIIKNFVKTMADRVALDLATARIGIINYSHKVEKVA
NLKQFSSKDDFKLAVDNMQYLGEGTYTATALQAANDMFEDARPGVKKVAL
VITDGQTDSRDKEKLTEVVKNASDTNVEIFVIGVVKKNDPNFEIFHKEMN
LIATDPEHVYQFDDFFTLQDTLKQKLFQKICEDFDSYLVQIFGSSSPQPG
FGMSGEELSESTPEPQKEISESLSVTRDQDEDDKAPEPTWADDLPATTSS
EATTTPRPLLSTPVDGAEDPRCLEALKPGNCGEYVVRWYYDKQVNSCARF
WFSGCNGSGNRFNSEKECQETCIQG

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22442 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, Q2UY09 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші