| LAMB1 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | LAMB1, CLM, LIS5, Laminin, beta 1, laminin subunit beta 1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 150240 MGI: 96743 HomoloGene: 1722 GeneCards: LAMB1 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| cobblestone lissencephaly without muscular or ocular involvement[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent
• structural molecule activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• integrin binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • laminin-8 complex
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• laminin-2 complex
• extracellular region
• базальна мембрана
• laminin-10 complex
• perinuclear region of cytoplasm
• laminin-1 complex
• екзосома
• міжклітинний простір
• endoplasmic reticulum lumen
• collagen-containing extracellular matrix
• laminin complex
|
|---|
| Біологічний процес | • endodermal cell differentiation
• positive regulation of epithelial cell proliferation
• positive regulation of cell migration
• neuronal-glial interaction involved in cerebral cortex radial glia guided migration
• extracellular matrix organization
• odontogenesis
• адгезія клітин
• substrate adhesion-dependent cell spreading
• neuron projection development
• посттрансляційна модифікація
• animal organ morphogenesis
• гістогенез
• cell migration
• basement membrane assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 7: 107.92 – 108 Mb | Хр. 12: 31.32 – 31.38 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMB1 (англ. Laminin subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 786 амінокислот, а молекулярна маса — 198 038[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MGLLQLLAFS | | FLALCRARVR | | AQEPEFSYGC | | AEGSCYPATG | | DLLIGRAQKL |
| SVTSTCGLHK | | PEPYCIVSHL | | QEDKKCFICN | | SQDPYHETLN | | PDSHLIENVV |
| TTFAPNRLKI | | WWQSENGVEN | | VTIQLDLEAE | | FHFTHLIMTF | | KTFRPAAMLI |
| ERSSDFGKTW | | GVYRYFAYDC | | EASFPGISTG | | PMKKVDDIIC | | DSRYSDIEPS |
| TEGEVIFRAL | | DPAFKIEDPY | | SPRIQNLLKI | | TNLRIKFVKL | | HTLGDNLLDS |
| RMEIREKYYY | | AVYDMVVRGN | | CFCYGHASEC | | APVDGFNEEV | | EGMVHGHCMC |
| RHNTKGLNCE | | LCMDFYHDLP | | WRPAEGRNSN | | ACKKCNCNEH | | SISCHFDMAV |
| YLATGNVSGG | | VCDDCQHNTM | | GRNCEQCKPF | | YYQHPERDIR | | DPNFCERCTC |
| DPAGSQNEGI | | CDSYTDFSTG | | LIAGQCRCKL | | NVEGEHCDVC | | KEGFYDLSSE |
| DPFGCKSCAC | | NPLGTIPGGN | | PCDSETGHCY | | CKRLVTGQHC | | DQCLPEHWGL |
| SNDLDGCRPC | | DCDLGGALNN | | SCFAESGQCS | | CRPHMIGRQC | | NEVEPGYYFA |
| TLDHYLYEAE | | EANLGPGVSI | | VERQYIQDRI | | PSWTGAGFVR | | VPEGAYLEFF |
| IDNIPYSMEY | | DILIRYEPQL | | PDHWEKAVIT | | VQRPGRIPTS | | SRCGNTIPDD |
| DNQVVSLSPG | | SRYVVLPRPV | | CFEKGTNYTV | | RLELPQYTSS | | DSDVESPYTL |
| IDSLVLMPYC | | KSLDIFTVGG | | SGDGVVTNSA | | WETFQRYRCL | | ENSRSVVKTP |
| MTDVCRNIIF | | SISALLHQTG | | LACECDPQGS | | LSSVCDPNGG | | QCQCRPNVVG |
| RTCNRCAPGT | | FGFGPSGCKP | | CECHLQGSVN | | AFCNPVTGQC | | HCFQGVYARQ |
| CDRCLPGHWG | | FPSCQPCQCN | | GHADDCDPVT | | GECLNCQDYT | | MGHNCERCLA |
| GYYGDPIIGS | | GDHCRPCPCP | | DGPDSGRQFA | | RSCYQDPVTL | | QLACVCDPGY |
| IGSRCDDCAS | | GYFGNPSEVG | | GSCQPCQCHN | | NIDTTDPEAC | | DKETGRCLKC |
| LYHTEGEHCQ | | FCRFGYYGDA | | LQQDCRKCVC | | NYLGTVQEHC | | NGSDCQCDKA |
| TGQCLCLPNV | | IGQNCDRCAP | | NTWQLASGTG | | CDPCNCNAAH | | SFGPSCNEFT |
| GQCQCMPGFG | | GRTCSECQEL | | FWGDPDVECR | | ACDCDPRGIE | | TPQCDQSTGQ |
| CVCVEGVEGP | | RCDKCTRGYS | | GVFPDCTPCH | | QCFALWDVII | | AELTNRTHRF |
| LEKAKALKIS | | GVIGPYRETV | | DSVERKVSEI | | KDILAQSPAA | | EPLKNIGNLF |
| EEAEKLIKDV | | TEMMAQVEVK | | LSDTTSQSNS | | TAKELDSLQT | | EAESLDNTVK |
| ELAEQLEFIK | | NSDIRGALDS | | ITKYFQMSLE | | AEERVNASTT | | EPNSTVEQSA |
| LMRDRVEDVM | | MERESQFKEK | | QEEQARLLDE | | LAGKLQSLDL | | SAAAEMTCGT |
| PPGASCSETE | | CGGPNCRTDE | | GERKCGGPGC | | GGLVTVAHNA | | WQKAMDLDQD |
| VLSALAEVEQ | | LSKMVSEAKL | | RADEAKQSAE | | DILLKTNATK | | EKMDKSNEEL |
| RNLIKQIRNF | | LTQDSADLDS | | IEAVANEVLK | | MEMPSTPQQL | | QNLTEDIRER |
| VESLSQVEVI | | LQHSAADIAR | | AEMLLEEAKR | | ASKSATDVKV | | TADMVKEALE |
| EAEKAQVAAE | | KAIKQADEDI | | QGTQNLLTSI | | ESETAASEET | | LFNASQRISE |
| LERNVEELKR | | KAAQNSGEAE | | YIEKVVYTVK | | QSAEDVKKTL | | DGELDEKYKK |
| VENLIAKKTE | | ESADARRKAE | | MLQNEAKTLL | | AQANSKLQLL | | KDLERKYEDN |
| QRYLEDKAQE | | LARLEGEVRS | | LLKDISQKVA | | VYSTCL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vuolteenaho R., Chow L.T., Tryggvason K. (1990). Structure of the human laminin B1 chain gene. J. Biol. Chem. 265: 15611—15616. PMID 1975589
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6486 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P07942 (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
