| COL9A2 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | COL9A2, DJ39G22.4, EDM2, MED, STL5, collagen type IX alpha 2, collagen type IX alpha 2 chain |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 120260 MGI: 88466 HomoloGene: 37535 GeneCards: COL9A2 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
• extracellular matrix structural constituent
|
|---|
| Клітинна компонента | • extracellular region
• endoplasmic reticulum lumen
• Колаген
• collagen type IX trimer
• базальна мембрана
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • skeletal system development
• extracellular matrix organization
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 40.3 – 40.32 Mb | Хр. 4: 120.9 – 120.91 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL9A2 (англ. Collagen type IX alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 65 131[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAAATASPRS | | LLVLLQVVVL | | ALAQIRGPPG | | ERGPPGPPGP | | PGVPGSDGID |
| GDNGPPGKAG | | PPGPKGEPGK | | AGPDGPDGKP | | GIDGLTGAKG | | EPGPMGIPGV |
| KGQPGLPGPP | | GLPGPGFAGP | | PGPPGPVGLP | | GEIGIRGPKG | | DPGPDGPSGP |
| PGPPGKPGRP | | GTIQGLEGSA | | DFLCPTNCPP | | GMKGPPGLQG | | VKGHAGKRGI |
| LGDPGHQGKP | | GPKGDVGASG | | EQGIPGPPGP | | QGIRGYPGMA | | GPKGETGPHG |
| YKGMVGAIGA | | TGPPGEEGPR | | GPPGRAGEKG | | DEGSPGIRGP | | QGITGPKGAT |
| GPPGINGKDG | | TPGTPGMKGS | | AGQAGQPGSP | | GHQGLAGVPG | | QPGTKGGPGD |
| QGEPGPQGLP | | GFSGPPGKEG | | EPGPRGEIGP | | QGIMGQKGDQ | | GERGPVGQPG |
| PQGRQGPKGE | | QGPPGIPGPQ | | GLPGVKGDKG | | SPGKTGPRGK | | VGDPGVAGLP |
| GEKGEKGESG | | EPGPKGQQGV | | RGEPGYPGPS | | GDAGAPGVQG | | YPGPPGPRGL |
| AGNRGVPGQP | | GRQGVEGRDA | | TDQHIVDVAL | | KMLQEQLAEV | | AVSAKREALG |
| AVGMMGPPGP | | PGPPGYPGKQ | | GPHGHPGPRG | | VPGIVGAVGQ | | IGNTGPKGKR |
| GEKGDPGEVG | | RGHPGMPGPP | | GIPGLPGRPG | | QAINGKDGDR | | GSPGAPGEAG |
| RPGLPGPVGL | | PGFCEPAACL | | GASAYASARL | | TEPGSIKGP |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Peraelae M., Haenninen M., Haestbacka J., Elima K., Vuorio E. (1993). Molecular cloning of the human alpha 2(IX) collagen cDNA and assignment of the human COL9A2 gene to chromosome 1. FEBS Lett. 319: 177—180. PMID 8454052 DOI:10.1016/0014-5793(93)80062-Y
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2218 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q14055 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
