| COL9A3 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | COL9A3, DJ885L7.4.1, EDM3, IDD, MED, collagen type IX alpha 3, collagen type IX alpha 3 chain |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 120270 MGI: 894686 HomoloGene: 20438 GeneCards: COL9A3 |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
• extracellular matrix structural constituent
|
|---|
| Клітинна компонента | • collagen type IX trimer
• extracellular region
• Колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • male gonad development
• extracellular matrix organization
• female gonad development
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 20: 62.82 – 62.84 Mb | Хр. 2: 180.24 – 180.26 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL9A3 (англ. Collagen type IX alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 63 616[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAGPRACAPL | | LLLLLLGELL | | AAAGAQRVGL | | PGPPGPPGPP | | GKPGQDGIDG |
| EAGPPGLPGP | | PGPKGAPGKP | | GKPGEAGLPG | | LPGVDGLTGR | | DGPPGPKGAP |
| GERGSLGPPG | | PPGLGGKGLP | | GPPGEAGVSG | | PPGGIGLRGP | | PGPSGLPGLP |
| GPPGPPGPPG | | HPGVLPEGAT | | DLQCPSICPP | | GPPGPPGMPG | | FKGPTGYKGE |
| QGEVGKDGEK | | GDPGPPGPAG | | LPGSVGLQGP | | RGLRGLPGPL | | GPPGDRGPIG |
| FRGPPGIPGA | | PGKAGDRGER | | GPEGFRGPKG | | DLGRPGPKGT | | PGVAGPSGEP |
| GMPGKDGQNG | | VPGLDGQKGE | | AGRNGAPGEK | | GPNGLPGLPG | | RAGSKGEKGE |
| RGRAGELGEA | | GPSGEPGVPG | | DAGMPGERGE | | AGHRGSAGAL | | GPQGPPGAPG |
| VRGFQGQKGS | | MGDPGLPGPQ | | GLRGDVGDRG | | PGGAAGPKGD | | QGIAGSDGLP |
| GDKGELGPSG | | LVGPKGESGS | | RGELGPKGTQ | | GPNGTSGVQG | | VPGPPGPLGL |
| QGVPGVPGIT | | GKPGVPGKEA | | SEQRIRELCG | | GMISEQIAQL | | AAHLRKPLAP |
| GSIGRPGPAG | | PPGPPGPPGS | | IGHPGARGPP | | GYRGPTGELG | | DPGPRGNQGD |
| RGDKGAAGAG | | LDGPEGDQGP | | QGPQGVPGTS | | KDGQDGAPGE | | PGPPGDPGLP |
| GAIGAQGTPG | | ICDTSACQGA | | VLGGVGEKSG | | SRSS |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Peraelae M., Savontaus M., Metsaeranta M., Vuorio E. (1997). Developmental regulation of mRNA species for types II, IX and XI collagens during mouse embryogenesis. Biochem. J. 324: 209—216. PMID 9164858 DOI:10.1042/bj3240209
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2219 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q14050 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
