| LAMA2 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 4YEP, 4YEQ | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | LAMA2, LAMM, Laminin, alpha 2, laminin subunit alpha 2, MDC1A |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 156225 MGI: 99912 HomoloGene: 37306 GeneCards: LAMA2 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| бічний аміотрофічний склероз, аметропія, congenital merosin-deficient muscular dystrophy 1A[1] |
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| ocriplasmin[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • structural molecule activity
• signaling receptor binding
• extracellular matrix structural constituent
|
|---|
| Клітинна компонента | • extracellular region
• dendritic spine
• Сарколема
• базальна мембрана
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• neuromuscular junction
• synaptic cleft
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • muscle organ development
• regulation of cell migration
• positive regulation of synaptic transmission, cholinergic
• regulation of embryonic development
• regulation of cell adhesion
• axon guidance
• адгезія клітин
• Schwann cell differentiation
• extracellular matrix organization
• animal organ morphogenesis
• гістогенез
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 6: 128.88 – 129.52 Mb | Хр. 10: 26.86 – 27.5 Mb |
|---|
| PubMed search | [3] | [4] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMA2 (англ. Laminin subunit alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 122 амінокислот, а молекулярна маса — 343 905[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MPGAAGVLLL | | LLLSGGLGGV | | QAQRPQQQRQ | | SQAHQQRGLF | | PAVLNLASNA |
| LITTNATCGE | | KGPEMYCKLV | | EHVPGQPVRN | | PQCRICNQNS | | SNPNQRHPIT |
| NAIDGKNTWW | | QSPSIKNGIE | | YHYVTITLDL | | QQVFQIAYVI | | VKAANSPRPG |
| NWILERSLDD | | VEYKPWQYHA | | VTDTECLTLY | | NIYPRTGPPS | | YAKDDEVICT |
| SFYSKIHPLE | | NGEIHISLIN | | GRPSADDPSP | | ELLEFTSARY | | IRLRFQRIRT |
| LNADLMMFAH | | KDPREIDPIV | | TRRYYYSVKD | | ISVGGMCICY | | GHARACPLDP |
| ATNKSRCECE | | HNTCGDSCDQ | | CCPGFHQKPW | | RAGTFLTKTE | | CEACNCHGKA |
| EECYYDENVA | | RRNLSLNIRG | | KYIGGGVCIN | | CTQNTAGINC | | ETCTDGFFRP |
| KGVSPNYPRP | | CQPCHCDPIG | | SLNEVCVKDE | | KHARRGLAPG | | SCHCKTGFGG |
| VSCDRCARGY | | TGYPDCKACN | | CSGLGSKNED | | PCFGPCICKE | | NVEGGDCSRC |
| KSGFFNLQED | | NWKGCDECFC | | SGVSNRCQSS | | YWTYGKIQDM | | SGWYLTDLPG |
| RIRVAPQQDD | | LDSPQQISIS | | NAEARQALPH | | SYYWSAPAPY | | LGNKLPAVGG |
| QLTFTISYDL | | EEEEEDTERV | | LQLMIILEGN | | DLSISTAQDE | | VYLHPSEEHT |
| NVLLLKEESF | | TIHGTHFPVR | | RKEFMTVLAN | | LKRVLLQITY | | SFGMDAIFRL |
| SSVNLESAVS | | YPTDGSIAAA | | VEVCQCPPGY | | TGSSCESCWP | | RHRRVNGTIF |
| GGICEPCQCF | | GHAESCDDVT | | GECLNCKDHT | | GGPYCDKCLP | | GFYGEPTKGT |
| SEDCQPCACP | | LNIPSNNFSP | | TCHLDRSLGL | | ICDGCPVGYT | | GPRCERCAEG |
| YFGQPSVPGG | | SCQPCQCNDN | | LDFSIPGSCD | | SLSGSCLICK | | PGTTGRYCEL |
| CADGYFGDAV | | DAKNCQPCRC | | NAGGSFSEVC | | HSQTGQCECR | | ANVQGQRCDK |
| CKAGTFGLQS | | ARGCVPCNCN | | SFGSKSFDCE | | ESGQCWCQPG | | VTGKKCDRCA |
| HGYFNFQEGG | | CTACECSHLG | | NNCDPKTGRC | | ICPPNTIGEK | | CSKCAPNTWG |
| HSITTGCKAC | | NCSTVGSLDF | | QCNVNTGQCN | | CHPKFSGAKC | | TECSRGHWNY |
| PRCNLCDCFL | | PGTDATTCDS | | ETKKCSCSDQ | | TGQCTCKVNV | | EGIHCDRCRP |
| GKFGLDAKNP | | LGCSSCYCFG | | TTTQCSEAKG | | LIRTWVTLKA | | EQTILPLVDE |
| ALQHTTTKGI | | VFQHPEIVAH | | MDLMREDLHL | | EPFYWKLPEQ | | FEGKKLMAYG |
| GKLKYAIYFE | | AREETGFSTY | | NPQVIIRGGT | | PTHARIIVRH | | MAAPLIGQLT |
| RHEIEMTEKE | | WKYYGDDPRV | | HRTVTREDFL | | DILYDIHYIL | | IKATYGNFMR |
| QSRISEISME | | VAEQGRGTTM | | TPPADLIEKC | | DCPLGYSGLS | | CEACLPGFYR |
| LRSQPGGRTP | | GPTLGTCVPC | | QCNGHSSLCD | | PETSICQNCQ | | HHTAGDFCER |
| CALGYYGIVK | | GLPNDCQQCA | | CPLISSSNNF | | SPSCVAEGLD | | DYRCTACPRG |
| YEGQYCERCA | | PGYTGSPGNP | | GGSCQECECD | | PYGSLPVPCD | | PVTGFCTCRP |
| GATGRKCDGC | | KHWHAREGWE | | CVFCGDECTG | | LLLGDLARLE | | QMVMSINLTG |
| PLPAPYKMLY | | GLENMTQELK | | HLLSPQRAPE | | RLIQLAEGNL | | NTLVTEMNEL |
| LTRATKVTAD | | GEQTGQDAER | | TNTRAKSLGE | | FIKELARDAE | | AVNEKAIKLN |
| ETLGTRDEAF | | ERNLEGLQKE | | IDQMIKELRR | | KNLETQKEIA | | EDELVAAEAL |
| LKKVKKLFGE | | SRGENEEMEK | | DLREKLADYK | | NKVDDAWDLL | | REATDKIREA |
| NRLFAVNQKN | | MTALEKKKEA | | VESGKRQIEN | | TLKEGNDILD | | EANRLADEIN |
| SIIDYVEDIQ | | TKLPPMSEEL | | NDKIDDLSQE | | IKDRKLAEKV | | SQAESHAAQL |
| NDSSAVLDGI | | LDEAKNISFN | | ATAAFKAYSN | | IKDYIDEAEK | | VAKEAKDLAH |
| EATKLATGPR | | GLLKEDAKGC | | LQKSFRILNE | | AKKLANDVKE | | NEDHLNGLKT |
| RIENADARNG | | DLLRTLNDTL | | GKLSAIPNDT | | AAKLQAVKDK | | ARQANDTAKD |
| VLAQITELHQ | | NLDGLKKNYN | | KLADSVAKTN | | AVVKDPSKNK | | IIADADATVK |
| NLEQEADRLI | | DKLKPIKELE | | DNLKKNISEI | | KELINQARKQ | | ANSIKVSVSS |
| GGDCIRTYKP | | EIKKGSYNNI | | VVNVKTAVAD | | NLLFYLGSAK | | FIDFLAIEMR |
| KGKVSFLWDV | | GSGVGRVEYP | | DLTIDDSYWY | | RIVASRTGRN | | GTISVRALDG |
| PKASIVPSTH | | HSTSPPGYTI | | LDVDANAMLF | | VGGLTGKLKK | | ADAVRVITFT |
| GCMGETYFDN | | KPIGLWNFRE | | KEGDCKGCTV | | SPQVEDSEGT | | IQFDGEGYAL |
| VSRPIRWYPN | | ISTVMFKFRT | | FSSSALLMYL | | ATRDLRDFMS | | VELTDGHIKV |
| SYDLGSGMAS | | VVSNQNHNDG | | KWKSFTLSRI | | QKQANISIVD | | IDTNQEENIA |
| TSSSGNNFGL | | DLKADDKIYF | | GGLPTLRNLS | | MKARPEVNLK | | KYSGCLKDIE |
| ISRTPYNILS | | SPDYVGVTKG | | CSLENVYTVS | | FPKPGFVELS | | PVPIDVGTEI |
| NLSFSTKNES | | GIILLGSGGT | | PAPPRRKRRQ | | TGQAYYAILL | | NRGRLEVHLS |
| TGARTMRKIV | | IRPEPNLFHD | | GREHSVHVER | | TRGIFTVQVD | | ENRRYMQNLT |
| VEQPIEVKKL | | FVGGAPPEFQ | | PSPLRNIPPF | | EGCIWNLVIN | | SVPMDFARPV |
| SFKNADIGRC | | AHQKLREDED | | GAAPAEIVIQ | | PEPVPTPAFP | | TPTPVLTHGP |
| CAAESEPALL | | IGSKQFGLSR | | NSHIAIAFDD | | TKVKNRLTIE | | LEVRTEAESG |
| LLFYMARINH | | ADFATVQLRN | | GLPYFSYDLG | | SGDTHTMIPT | | KINDGQWHKI |
| KIMRSKQEGI | | LYVDGASNRT | | ISPKKADILD | | VVGMLYVGGL | | PINYTTRRIG |
| PVTYSIDGCV | | RNLHMAEAPA | | DLEQPTSSFH | | VGTCFANAQR | | GTYFDGTGFA |
| KAVGGFKVGL | | DLLVEFEFRT | | TTTTGVLLGI | | SSQKMDGMGI | | EMIDEKLMFH |
| VDNGAGRFTA | | VYDAGVPGHL | | CDGQWHKVTA | | NKIKHRIELT | | VDGNQVEAQS |
| PNPASTSADT | | NDPVFVGGFP | | DDLKQFGLTT | | SIPFRGCIRS | | LKLTKGTGKP |
| LEVNFAKALE | | LRGVQPVSCP | | AN |
Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Zhang X., Vuolteenaho R., Tryggvason K. (1996). Structure of the human laminin alpha2-chain gene (LAMA2), which is affected in congenital muscular dystrophy. J. Biol. Chem. 271: 27664—27669. PMID 8910357 DOI:10.1074/jbc.271.44.27664
- Ehrig K., Leivo I., Argraves W.S., Ruoslahti E., Engvall E. (1990). Merosin, a tissue-specific basement membrane protein, is a laminin-like protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 3264—3268. PMID 2185464 DOI:10.1073/pnas.87.9.3264
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6482 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P24043 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
