| COMP |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | COMP, EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5, cartilage oligomeric matrix protein, TSP5, CTS2 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 600310 MGI: 88469 HomoloGene: 74 GeneCards: COMP |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| pseudoachondroplasia[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • protease binding
• calcium ion binding
• heparan sulfate proteoglycan binding
• heparin binding
• extracellular matrix structural constituent
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• collagen binding
• integrin binding
• BMP binding
• proteoglycan binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця
• екзосома
• міжклітинний простір
• extracellular region
• GO:0009327 protein-containing complex
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • animal organ morphogenesis
• growth plate cartilage development
• skeletal system development
• адгезія клітин
• extracellular matrix organization
• negative regulation of apoptotic process
• limb development
• GO:0097285 апоптоз
• осифікація
• chondrocyte development
• endochondral bone growth
• response to unfolded protein
• зсідання крові
• protein secretion
• multicellular organism aging
• регуляція експресії генів
• vascular associated smooth muscle contraction
• protein processing
• collagen fibril organization
• bone mineralization
• regulation of bone mineralization
• BMP signaling pathway
• multicellular organism growth
• chondrocyte proliferation
• tendon development
• skin development
• artery morphogenesis
• musculoskeletal movement
• neuromuscular process
• cartilage development
• bone morphogenesis
• platelet aggregation
• vascular associated smooth muscle cell development
• bone growth
• negative regulation of hemostasis
• positive regulation of chondrocyte proliferation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 18.78 – 18.79 Mb | Хр. 8: 70.83 – 70.83 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COMP (англ. Cartilage oligomeric matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 82 860[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MVPDTACVLL | | LTLAALGASG | | QGQSPLGSDL | | GPQMLRELQE | | TNAALQDVRE |
| LLRQQVREIT | | FLKNTVMECD | | ACGMQQSVRT | | GLPSVRPLLH | | CAPGFCFPGV |
| ACIQTESGAR | | CGPCPAGFTG | | NGSHCTDVNE | | CNAHPCFPRV | | RCINTSPGFR |
| CEACPPGYSG | | PTHQGVGLAF | | AKANKQVCTD | | INECETGQHN | | CVPNSVCINT |
| RGSFQCGPCQ | | PGFVGDQASG | | CQRRAQRFCP | | DGSPSECHEH | | ADCVLERDGS |
| RSCVCAVGWA | | GNGILCGRDT | | DLDGFPDEKL | | RCPERQCRKD | | NCVTVPNSGQ |
| EDVDRDGIGD | | ACDPDADGDG | | VPNEKDNCPL | | VRNPDQRNTD | | EDKWGDACDN |
| CRSQKNDDQK | | DTDQDGRGDA | | CDDDIDGDRI | | RNQADNCPRV | | PNSDQKDSDG |
| DGIGDACDNC | | PQKSNPDQAD | | VDHDFVGDAC | | DSDQDQDGDG | | HQDSRDNCPT |
| VPNSAQEDSD | | HDGQGDACDD | | DDDNDGVPDS | | RDNCRLVPNP | | GQEDADRDGV |
| GDVCQDDFDA | | DKVVDKIDVC | | PENAEVTLTD | | FRAFQTVVLD | | PEGDAQIDPN |
| WVVLNQGREI | | VQTMNSDPGL | | AVGYTAFNGV | | DFEGTFHVNT | | VTDDDYAGFI |
| FGYQDSSSFY | | VVMWKQMEQT | | YWQANPFRAV | | AEPGIQLKAV | | KSSTGPGEQL |
| RNALWHTGDT | | ESQVRLLWKD | | PRNVGWKDKK | | SYRWFLQHRP | | QVGYIRVRFY |
| EGPELVADSN | | VVLDTTMRGG | | RLGVFCFSQE | | NIIWANLRYR | | CNDTIPEDYE |
| THQLRQA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen H., Deere M., Hecht J.T., Lawler J. (2000). Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium-binding protein, and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes. J. Biol. Chem. 275: 26538—26544. PMID 10852928 DOI:10.1074/jbc.M909780199
- Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200
- Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
- Koelling S., Clauditz T.S., Kaste M., Miosge N. (2006). Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis. Arthritis Res. Ther. 8: R56—R56. PMID 16542502 DOI:10.1186/ar1922
- Gagarina V., Carlberg A.L., Pereira-Mouries L., Hall D.J. (2008). Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins. J. Biol. Chem. 283: 648—659. PMID 17993464 DOI:10.1074/jbc.M704035200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COMP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2227 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P49747 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
