LSM7

LSM7
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

3JCR

معرفات
أسماء بديلة LSM7, YNL147W, homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607287 MGI: MGI:1913344 HomoloGene: 6781 GeneCards: 51690
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
RNA binding
U6 snRNA binding

مكونات خلوية

عصارة خلوية
catalytic step 2 spliceosome
spliceosomal tri-snRNP complex
U6 snRNP
U12-type spliceosomal complex
بلازم نووي
Lsm1-7-Pat1 complex
spliceosomal complex
U2-type prespliceosome
نواة
U4/U6 x U5 tri-snRNP complex
U2-type precatalytic spliceosome
Lsm2-8 complex

عمليات حيوية

mRNA splicing, via spliceosome
‏GO:0033168، ‏GO:0036404، ‏GO:1902360 المعالجة
mRNA processing
exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
تضفير الآر أن إيه
nuclear-transcribed mRNA catabolic process

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 51690 66094
Ensembl ENSG00000130332 ENSMUSG00000035215
يونيبروت

Q9UK45

Q9CQQ8

RefSeq (رنا مرسال.)

NM_016199

‏NM_001359148، ‏NM_001359149، ‏NM_001359150 NM_025349، ‏NM_001359148، ‏NM_001359149، ‏NM_001359150

RefSeq (بروتين)

‏XP_016882358 NP_057283، ‏XP_016882358

‏NP_001346077، ‏NP_001346078، ‏NP_001346079 NP_079625، ‏NP_001346077، ‏NP_001346078، ‏NP_001346079

الموقع (UCSC n/a Chr 10: 80.69 – 80.69 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

LSM7‏ (LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين LSM7 في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: LSM7 LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Ingelfinger D، Arndt-Jovin DJ، Lührmann R، Achsel T (ديسمبر 2002). "The human LSm1-7 proteins colocalize with the mRNA-degrading enzymes Dcp1/2 and Xrnl in distinct cytoplasmic foci". RNA. ج. 8 ع. 12: 1489–501. DOI:10.1017/S1355838202021726. PMC:1370355. PMID:12515382.
  3. ^ Achsel T، Brahms H، Kastner B، Bachi A، Wilm M، Lührmann R (أكتوبر 1999). "A doughnut-shaped heteromer of human Sm-like proteins binds to the 3'-end of U6 snRNA, thereby facilitating U4/U6 duplex formation in vitro". The EMBO Journal. ج. 18 ع. 20: 5789–802. DOI:10.1093/emboj/18.20.5789. PMC:1171645. PMID:10523320.

قراءة متعمقة

  • Friesen WJ، Dreyfuss G (أغسطس 2000). "Specific sequences of the Sm and Sm-like (Lsm) proteins mediate their interaction with the spinal muscular atrophy disease gene product (SMN)". The Journal of Biological Chemistry. ج. 275 ع. 34: 26370–5. DOI:10.1074/jbc.M003299200. PMID:10851237.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Suzuki H، Fukunishi Y، Kagawa I، Saito R، Oda H، Endo T، Kondo S، Bono H، Okazaki Y، Hayashizaki Y (أكتوبر 2001). "Protein-protein interaction panel using mouse full-length cDNAs". Genome Research. ج. 11 ع. 10: 1758–65. DOI:10.1101/gr.180101. PMC:311163. PMID:11591653.
  • Eystathioy T، Peebles CL، Hamel JC، Vaughn JH، Chan EK (مارس 2002). "Autoantibody to hLSm4 and the heptameric LSm complex in anti-Sm sera". Arthritis and Rheumatism. ج. 46 ع. 3: 726–34. DOI:10.1002/art.10220. PMID:11920408.
  • Conte N، Charafe-Jauffret E، Delaval B، Adélaïde J، Ginestier C، Geneix J، Isnardon D، Jacquemier J، Birnbaum D (أغسطس 2002). "Carcinogenesis and translational controls: TACC1 is down-regulated in human cancers and associates with mRNA regulators". Oncogene. ج. 21 ع. 36: 5619–30. DOI:10.1038/sj.onc.1205658. PMID:12165861.
  • Conte N، Delaval B، Ginestier C، Ferrand A، Isnardon D، Larroque C، Prigent C، Séraphin B، Jacquemier J، Birnbaum D (نوفمبر 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A protein complex in breast cancer". Oncogene. ج. 22 ع. 50: 8102–16. DOI:10.1038/sj.onc.1206972. PMID:14603251.
  • Lehner B، Semple JI، Brown SE، Counsell D، Campbell RD، Sanderson CM (يناير 2004). "Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region". Genomics. ج. 83 ع. 1: 153–67. DOI:10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID:14667819.
  • Lehner B، Sanderson CM (يوليو 2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Research. ج. 14 ع. 7: 1315–23. DOI:10.1101/gr.2122004. PMC:442147. PMID:15231747.
  • Stanĕk D، Neugebauer KM (سبتمبر 2004). "Detection of snRNP assembly intermediates in Cajal bodies by fluorescence resonance energy transfer". The Journal of Cell Biology. ج. 166 ع. 7: 1015–25. DOI:10.1083/jcb.200405160. PMC:2172029. PMID:15452143.
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 19
جينات الكروموسوم 19
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية