FOXC2

FOXC2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1D5V

Ідентифікатори
Символи FOXC2, FKHL14, LD, MFH-1, MFH1, forkhead box C2
Зовнішні ІД OMIM: 602402 MGI: 1347481 HomoloGene: 21091 GeneCards: FOXC2
Пов'язані генетичні захворювання
Lymphedema–distichiasis syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
chromatin DNA binding
promoter-specific chromatin binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
Нуклеоплазма
Ядерні тільця

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
somitogenesis
embryonic skeletal system morphogenesis
skeletal system development
GO:1901047 insulin receptor signaling pathway
ureteric bud development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
neural crest cell development
paraxial mesoderm formation
paraxial mesodermal cell fate commitment
Осифікація
lymphangiogenesis
collagen fibril organization
розвиток нирки
glomerular mesangial cell development
heart morphogenesis
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cardiac muscle cell proliferation
lymph vessel development
transcription, DNA-templated
embryonic heart tube development
positive regulation of endothelial cell migration
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism development
ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
heart development
blood vessel remodeling
vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
blood vessel development
positive regulation of vascular wound healing
artery morphogenesis
branching involved in blood vessel morphogenesis
glomerular visceral epithelial cell differentiation
response to hormone
embryonic viscerocranium morphogenesis
embryonic cranial skeleton morphogenesis
camera-type eye development
glomerular endothelium development
positive regulation of cell adhesion mediated by integrin
mesoderm development
regulation of organ growth
metanephros development
проліферація
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of apoptotic process involved in outflow tract morphogenesis
transcription by RNA polymerase II
диференціація клітин
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
anatomical structure morphogenesis
negative regulation of cold-induced thermogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2303
14234
Ensembl
ENSG00000176692
ENSMUSG00000046714
UniProt
Q99958
Q61850
RefSeq (мРНК)
NM_005251
NM_013519
RefSeq (білок)
NP_005242
NP_038547
Локус (UCSC) Хр. 16: 86.57 – 86.57 Mb Хр. 8: 121.84 – 121.85 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXC2 (англ. Forkhead box C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 53 719[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQARYSVSDPNALGVVPYLSEQNYYRAAGSYGGMASPMGVYSGHPEQYSA
GMGRSYAPYHHHQPAAPKDLVKPPYSYIALITMAIQNAPEKKITLNGIYQ
FIMDRFPFYRENKQGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDP
DSYNMFENGSFLRRRRRFKKKDVSKEKEERAHLKEPPPAASKGAPATPHL
ADAPKEAEKKVVIKSEAASPALPVITKVETLSPESALQGSPRSAASTPAG
SPDGSLPEHHAAAPNGLPGFSVENIMTLRTSPPGGELSPGAGRAGLVVPP
LALPYAAAPPAAYGQPCAQGLEAGAAGGYQCSMRAMSLYTGAERPAHMCV
PPALDEALSDHPSGPTSPLSALNLAAGQEGALAATGHHHQHHGHHHPQAP
PPPPAPQPQPTPQPGAAAAQAASWYLNHSGDLNHLPGHTFAAQQQTFPNV
REMFNSHRLGIENSTLGESQVSGNASCQLPYRSTPPLYRHAAPYSYDCTK
Y

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Miura N., Iida K., Kakinuma H., Yang X.-L., Sugiyama T. (1997). Isolation of the mouse (MFH-1) and human (FKHL 14) mesenchyme fork head-1 genes reveals conservation of their gene and protein structures. Genomics. 41: 489—492. PMID 9169153 DOI:10.1006/geno.1997.4695
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • van Dongen M.J., Cederberg A., Carlsson P., Enerback S., Wikstrom M. (2000). Solution structure and dynamics of the DNA-binding domain of the adipocyte-transcription factor FREAC-11. J. Mol. Biol. 296: 351—359. PMID 10669593 DOI:10.1006/jmbi.1999.3476

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з FOXC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3801 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q99958 (англ.) . Архів оригіналу за 4 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші