ZNF638 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF638, NP220, ZFML, Zfp638, zinc finger protein 638 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 614349 MGI: 1203484 HomoloGene: 7447 GeneCards: ZNF638 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • DNA binding • zinc ion binding • double-stranded DNA binding • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • nuclear speck • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001014972 NM_001252612 NM_001252613 NM_014497 |
| | NM_001166371 NM_008717 NM_001355284 NM_001355285 NM_001355286 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001014972 NP_001239541 NP_001239542 NP_055312 |
| NP_001159843 NP_032743 NP_001342213 NP_001342214 NP_001342215
| NP_001393000 NP_001393001 NP_001393002 NP_001393003 NP_001393004 NP_001393005 NP_001393006 NP_001393007 NP_001393008 NP_001393009 NP_001393010 NP_001393011 NP_001393012 NP_001393013 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 71.28 – 71.44 Mb | Хр. 6: 83.84 – 83.97 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF638 (англ. Zinc finger protein 638) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 978 амінокислот, а молекулярна маса — 220 625[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSRPRFNPRG | | DFPLQRPRAP | | NPSGMRPPGP | | FMRPGSMGLP | | RFYPAGRARG |
IPHRFAGHES | | YQNMGPQRMN | | VQVTQHRTDP | | RLTKEKLDFH | | EAQQKKGKPH |
GSRWDDEPHI | | SASVAVKQSS | | VTQVTEQSPK | | VQSRYTKESA | | SSILASFGLS |
NEDLEELSRY | | PDEQLTPENM | | PLILRDIRMR | | KMGRRLPNLP | | SQSRNKETLG |
SEAVSSNVID | | YGHASKYGYT | | EDPLEVRIYD | | PEIPTDEVEN | | EFQSQQNISA |
SVPNPNVICN | | SMFPVEDVFR | | QMDFPGESSN | | NRSFFSVESG | | TKMSGLHISG |
GQSVLEPIKS | | VNQSINQTVS | | QTMSQSLIPP | | SMNQQPFSSE | | LISSVSQQER |
IPHEPVINSS | | NVHVGSRGSK | | KNYQSQADIP | | IRSPFGIVKA | | SWLPKFSHAD |
AQKMKRLPTP | | SMMNDYYAAS | | PRIFPHLCSL | | CNVECSHLKD | | WIQHQNTSTH |
IESCRQLRQQ | | YPDWNPEILP | | SRRNEGNRKE | | NETPRRRSHS | | PSPRRSRRSS |
SSHRFRRSRS | | PMHYMYRPRS | | RSPRICHRFI | | SRYRSRSRSR | | SPYRIRNPFR |
GSPKCFRSVS | | PERMSRRSVR | | SSDRKKALED | | VVQRSGHGTE | | FNKQKHLEAA |
DKGHSPAQKP | | KTSSGTKPSV | | KPTSATKSDS | | NLGGHSIRCK | | SKNLEDDTLS |
ECKQVSDKAV | | SLQRKLRKEQ | | SLHYGSVLLI | | TELPEDGCTE | | EDVRKLFQPF |
GKVNDVLIVP | | YRKEAYLEME | | FKEAITAIMK | | YIETTPLTIK | | GKSVKICVPG |
KKKAQNKEVK | | KKTLESKKVS | | ASTLKRDADA | | SKAVEIVTST | | SAAKTGQAKA |
SVAKVNKSTG | | KSASSVKSVV | | TVAVKGNKAS | | IKTAKSGGKK | | SLEAKKTGNV |
KNKDSNKPVT | | IPENSEIKTS | | IEVKATENCA | | KEAISDAALE | | ATENEPLNKE |
TEEMCVMLVS | | NLPNKGYSVE | | EVYDLAKPFG | | GLKDILILSS | | HKKAYIEINR |
KAAESMVKFY | | TCFPVLMDGN | | QLSISMAPEN | | MNIKDEEAIF | | ITLVKENDPE |
ANIDTIYDRF | | VHLDNLPEDG | | LQCVLCVGLQ | | FGKVDHHVFI | | SNRNKAILQL |
DSPESAQSMY | | SFLKQNPQNI | | GDHMLTCSLS | | PKIDLPEVQI | | EHDPELEKES |
PGLKNSPIDE | | SEVQTATDSP | | SVKPNELEEE | | STPSIQTETL | | VQQEEPCEEE |
AEKATCDSDF | | AVETLELETQ | | GEEVKEEIPL | | VASASVSIEQ | | FTENAEECAL |
NQQMFNSDLE | | KKGAEIINPK | | TALLPSDSVF | | AEERNLKGIL | | EESPSEAEDF |
ISGITQTMVE | | AVAEVEKNET | | VSEILPSTCI | | VTLVPGIPTG | | DEKTVDKKNI |
SEKKGNMDEK | | EEKEFNTKET | | RMDLQIGTEK | | AEKNEGRMDA | | EKVEKMAAMK |
EKPAENTLFK | | AYPNKGVGQA | | NKPDETSKTS | | ILAVSDVSSS | | KPSIKAVIVS |
SPKAKATVSK | | TENQKSFPKS | | VPRDQINAEK | | KLSAKEFGLL | | KPTSARSGLA |
ESSSKFKPTQ | | SSLTRGGSGR | | ISALQGKLSK | | LDYRDITKQS | | QETEARPSIM |
KRDDSNNKTL | | AEQNTKNPKS | | TTGRSSKSKE | | EPLFPFNLDE | | FVTVDEVIEE |
VNPSQAKQNP | | LKGKRKETLK | | NVPFSELNLK | | KKKGKTSTPR | | GVEGELSFVT |
LDEIGEEEDA | | AAHLAQALVT | | VDEVIDEEEL | | NMEEMVKNSN | | SLFTLDELID |
QDDCISHSEP | | KDVTVLSVAE | | EQDLLKQERL | | VTVDEIGEVE | | ELPLNESADI |
TFATLNTKGN | | EGDTVRDSIG | | FISSQVPEDP | | STLVTVDEIQ | | DDSSDLHLVT |
LDEVTEEDED | | SLADFNNLKE | | ELNFVTVDEV | | GEEEDGDNDL | | KVELAQSKND |
HPTDKKGNRK | | KRAVDTKKTK | | LESLSQVGPV | | NENVMEEDLK | | TMIERHLTAK |
TPTKRVRIGK | | TLPSEKAVVT | | EPAKGEEAFQ | | MSEVDEESGL | | KDSEPERKRK |
KTEDSSSGKS | | VASDVPEELD | | FLVPKAGFFC | | PICSLFYSGE | | KAMTNHCKST |
RHKQNTEKFM | | AKQRKEKEQN | | EAEERSSR |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17894 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q14966 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|