NKX2-2

NKX2-2
Ідентифікатори
Символи NKX2-2, NKX2.2, NKX2B, NK2 homeobox 2
Зовнішні ІД OMIM: 604612 MGI: 97347 HomoloGene: 1879 GeneCards: NKX2-2
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

внутрішньоклітинний
нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

positive regulation of oligodendrocyte differentiation
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of neuron differentiation
pancreatic PP cell fate commitment
GO:1904578 response to organic cyclic compound
розвиток клітин
spinal cord oligodendrocyte cell fate specification
response to progesterone
neuron fate specification
response to glucose
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
multicellular organism development
brain development
astrocyte differentiation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of neuron differentiation
positive regulation of cell differentiation
регуляція диференціювання клітин
smoothened signaling pathway
oligodendrocyte development
spinal cord motor neuron differentiation
digestive tract development
pancreatic A cell fate commitment
type B pancreatic cell fate commitment
ventral spinal cord interneuron fate determination
type B pancreatic cell development
spinal cord oligodendrocyte cell differentiation
optic nerve development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
endocrine pancreas development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4821
18088
Ensembl
ENSG00000125820
ENSMUSG00000027434
UniProt
O95096
P42586
RefSeq (мРНК)
NM_002509
NM_001077632
NM_010919
RefSeq (білок)
NP_002500
NP_001071100
NP_035049
Локус (UCSC) Хр. 20: 21.51 – 21.51 Mb Хр. 2: 147.18 – 147.19 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX2-2 (англ. NK2 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 133[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLTNTKTGFSVKDILDLPDTNDEEGSVAEGPEEENEGPEPAKRAGPLGQ
GALDAVQSLPLKNPFYDSSDNPYTRWLASTEGLQYSLHGLAAGAPPQDSS
SKSPEPSADESPDNDKETPGGGGDAGKKRKRRVLFSKAQTYELERRFRQQ
RYLSAPEREHLASLIRLTPTQVKIWFQNHRYKMKRARAEKGMEVTPLPSP
RRVAVPVLVRDGKPCHALKAQDLAAATFQAGIPFSAYSAQSLQHMQYNAQ
YSSASTPQYPTAHPLVQAQQWTW

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7835 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, O95096 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші