HIVEP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BBO, 4ZNF | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, HIVEP zinc finger 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 194540 MGI: 96100 HomoloGene: 1596 GeneCards: HIVEP1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
токсикоманія[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • BMP signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 12.01 – 12.16 Mb | Хр. 13: 42.21 – 42.35 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
HIVEP1 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 718 амінокислот, а молекулярна маса — 296 865[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPRTKQIHPR | | NLRDKIEEAQ | | KELNGAEVSK | | KEILQAGVKG | | TSESLKGVKR |
KKIVAENHLK | | KIPKSPLRNP | | LQAKHKQNTE | | ESSFAVLHSA | | SESHKKQNYI |
PVKNGKQFTK | | QNGETPGIIA | | EASKSEESVS | | PKKPLFLQQP | | SELRRWRSEG |
ADPAKFSDLD | | EQCDSSSLSS | | KTRTDNSECI | | SSHCGTTSPS | | YTNTAFDVLL |
KAMEPELSTL | | SQKGSPCAIK | | TEKLRPNKTA | | RSPPKLKNSS | | MDAPNQTSQE |
LVAESQSSCT | | SYTVHMSAAQ | | KNEQGAMQSA | | SHLYHQHEHF | | VPKSNQHNQQ |
LPGCSGFTGS | | LTNLQNQENA | | KLEQVYNIAV | | TSSVGLTSPS | | SRSQVTPQNQ |
QMDSASPLSI | | SPANSTQSPP | | MPIYNSTHVA | | SVVNQSVEQM | | CNLLLKDQKP |
KKQGKYICEY | | CNRACAKPSV | | LLKHIRSHTG | | ERPYPCVTCG | | FSFKTKSNLY |
KHKKSHAHTI | | KLGLVLQPDA | | GGLFLSHESP | | KALSIHSDVE | | DSGESEEEGA |
TDERQHDLGA | | MELQPVHIIK | | RMSNAETLLK | | SSFTPSSPEN | | VIGDFLLQDR |
SAESQAVTEL | | PKVVVHHVTV | | SPLRTDSPKA | | MDPKPELSSA | | QKQKDLQVTN |
VQPLSANMSQ | | GGVSRLETNE | | NSHQKGDMNP | | LEGKQDSHVG | | TVHAQLQRQQ |
ATDYSQEQQG | | KLLSPRSLGS | | TDSGYFSRSE | | SADQTVSPPT | | PFARRLPSTE |
QDSGRSNGPS | | AALVTTSTPS | | ALPTGEKALL | | LPGQMRPPLA | | TKTLEERISK |
LISDNEALVD | | DKQLDSVKPR | | RTSLSRRGSI | | DSPKSYIFKD | | SFQFDLKPVG |
RRTSSSSDIP | | KSPFTPTEKS | | KQVFLLSVPS | | LDCLPITRSN | | SMPTTGYSAV |
PANIIPPPHP | | LRGSQSFDDK | | IGTFYDDVFV | | SGPNAPVPQS | | GHPRTLVRQA |
AIEDSSANES | | HVLGTGQSLD | | ESHQGCHAAG | | EAMSVRSKAL | | AQGPHIEKKK |
SHQGRGTMFE | | CETCRNRYRK | | LENFENHKKF | | YCSELHGPKT | | KVAMREPEHS |
PVPGGLQPQI | | LHYRVAGSSG | | IWEQTPQIRK | | RRKMKSVGDD | | EELQQNESGT |
SPKSSEGLQF | | QNALGCNPSL | | PKHNVTIRSD | | QQHKNIQLQN | | SHIHLVARGP |
EQTMDPKLST | | IMEQQISSAA | | QDKIELQRHG | | TGISVIQHTN | | SLSRPNSFDK |
PEPFERASPV | | SFQELNRTGK | | SGSLKVIGIS | | QEESHPSRDG | | SHPHQLALSD |
ALRGELQESS | | RKSPSERHVL | | GQPSRLVRQH | | NIQVPEILVT | | EEPDRDLEAQ |
CHDQEKSEKF | | SWPQRSETLS | | KLPTEKLPPK | | KKRLRLAEIE | | HSSTESSFDS |
TLSRSLSRES | | SLSHTSSFSA | | SLDIEDVSKT | | EASPKIDFLN | | KAEFLMIPAG |
LNTLNVPGCH | | REMRRTASEQ | | INCTQTSMEV | | SDLRSKSFDC | | GSITPPQTTP |
LTELQPPSSP | | SRVGVTGHVP | | LLERRRGPLV | | RQISLNIAPD | | SHLSPVHPTS |
FQNTALPSVN | | AVPYQGPQLT | | STSLAEFSAN | | TLHSQTQVKD | | LQAETSNSSS |
TNVFPVQQLC | | DINLLNQIHA | | PPSHQSTQLS | | LQVSTQGSKP | | DKNSVLSGSS |
KSEDCFAPKY | | QLHCQVFTSG | | PSCSSNPVHS | | LPNQVISDPV | | GTDHCVTSAT |
LPTKLIDSMS | | NSHPLLPPEL | | RPLGSQVQKV | | PSSFMLPIRL | | QSSVPAYCFA |
TLTSLPQILV | | TQDLPNQPIC | | QTNHSVVPIS | | EEQNSVPTLQ | | KGHQNALPNP |
EKEFLCENVF | | SEMSQNSSLS | | ESLPITQKIS | | VGRLSPQQES | | SASSKRMLSP |
ANSLDIAMEK | | HQKRAKDENG | | AVCATDVRPL | | EALSSRVNEA | | SKQKKPILVR |
QVCTTEPLDG | | VMLEKDVFSQ | | PEISNEAVNL | | TNVLPADNSS | | TGCSKFVVIE |
PISELQEFEN | | IKSSTSLTLT | | VRSSPAPSEN | | THISPLKCTD | | NNQERKSPGV |
KNQGDKVNIQ | | EQSQQPVTSL | | SLFNIKDTQQ | | LAFPSLKTTT | | NFTWCYLLRQ |
KSLHLPQKDQ | | KTSAYTDWTV | | SASNPNPLGL | | PTKVALALLN | | SKQNTGKSLY |
CQAITTHSKS | | DLLVYSSKWK | | SSLSKRALGN | | QKSTVVEFSN | | KDASEINSEQ |
DKENSLIKSE | | PRRIKIFDGG | | YKSNEEYVYV | | RGRGRGKYIC | | EECGIRCKKP |
SMLKKHIRTH | | TDVRPYHCTY | | CNFSFKTKGN | | LTKHMKSKAH | | SKKCVDLGVS |
VGLIDEQDTE | | ESDEKQRFSY | | ERSGYDLEES | | DGPDEDDNEN | | EDDDEDSQAE |
SVLSATPSVT | | ASPQHLPSRS | | SLQDPVSTDE | | DVRITDCFSG | | VHTDPMDVLP |
RALLTRMTVL | | STAQSDYNRK | | TLSPGKARQR | | AARDENDTIP | | SVDTSRSPCH |
QMSVDYPESE | | EILRSSMAGK | | AVAITQSPSS | | VRLPPAAAEH | | SPQTAAGMPS |
VASPHPDPQE | | QKQQITLQPT | | PGLPSPHTHL | | FSHLPLHSQQ | | QSRTPYNMVP |
VGGIHVVPAG | | LTYSTFVPLQ | | AGPVQLTIPA | | VSVVHRTLGT | | HRNTVTEVSG |
TTNPAGVAEL | | SSVVPCIPIG | | QIRVPGLQNL | | STPGLQSLPS | | LSMETVNIVG |
LANTNMAPQV | | HPPGLALNAV | | GLQVLTANPS | | SQSSPAPQAH | | IPGLQILNIA |
LPTLIPSVSQ | | VAVDAQGAPE | | MPASQSKACE | | TQPKQTSVAS | | ANQVSRTESP |
QGLPTVQREN | | AKKVLNPPAP | | AGDHARLDGL | | SKMDTEKAAS | | ANHVKPKPEL |
TSIQGQPAST | | SQPLLKAHSE | | VFTKPSGQQT | | LSPDRQVPRP | | TALPRRQPTV |
HFSDVSSDDD | | EDRLVIAT |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Fan C.M., Maniatis T. (1990). A DNA-binding protein containing two widely separated zinc finger motifs that recognize the same DNA sequence. Genes Dev. 4: 29—42. PMID 2106471 DOI:10.1101/gad.4.1.29
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Baldwin A.S. Jr., LeClair K.P., Singh H., Sharp P.A. (1990). A large protein containing zinc finger domains binds to related sequence elements in the enhancers of the class I major histocompatibility complex and kappa immunoglobulin genes. Mol. Cell. Biol. 10: 1406—1414. PMID 2108316 DOI:10.1128/MCB.10.4.1406
- Lallemand C., Palmieri M., Blanchard B., Meritet J.F., Tovey M.G. (2002). GAAP-1: a transcriptional activator of p53 and IRF-1 possesses pro-apoptotic activity. EMBO Rep. 3: 153—158. PMID 11818340 DOI:10.1093/embo-reports/kvf032
- Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
- Omichinski J.G., Clore G.M., Appella E., Sakaguchi K., Gronenborn A.M. (1990). High-resolution three-dimensional structure of a single zinc finger from a human enhancer binding protein in solution. Biochemistry. 29: 9324—9334. PMID 2248949 DOI:10.1021/bi00492a004
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з HIVEP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4920 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P15822 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|