GTF2F2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BBY, 1F3U, 2BBY, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | GTF2F2, BTF4, RAP30, TF2F2, TFIIF, general transcription factor IIF subunit 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 189969 MGI: 1915955 HomoloGene: 37884 GeneCards: GTF2F2 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding |
---|
Клітинна компонента | • microtubule cytoskeleton • нуклеоплазма • transcription factor TFIIF complex • клітинне ядро • transcription preinitiation complex |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription initiation from RNA polymerase II promoter • transcription, DNA-templated • positive regulation of viral transcription • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • RNA metabolic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 45.12 – 45.28 Mb | Хр. 14: 76.13 – 76.25 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GTF2F2 (англ. General transcription factor IIF subunit 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 28 380[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAERGELDLT | | GAKQNTGVWL | | VKVPKYLSQQ | | WAKASGRGEV | | GKLRIAKTQG |
RTEVSFTLNE | | DLANIHDIGG | | KPASVSAPRE | | HPFVLQSVGG | | QTLTVFTESS |
SDKLSLEGIV | | VQRAECRPAA | | SENYMRLKRL | | QIEESSKPVR | | LSQQLDKVVT |
TNYKPVANHQ | | YNIEYERKKK | | EDGKRARADK | | QHVLDMLFSA | | FEKHQYYNLK |
DLVDITKQPV | | VYLKEILKEI | | GVQNVKGIHK | | NTWELKPEYR | | HYQGEEKSD |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Sopta M., Burton Z.F., Greenblatt J. (1989). Structure and associated DNA-helicase activity of a general transcription initiation factor that binds to RNA polymerase II. Nature. 341: 410—414. PMID 2477704 DOI:10.1038/341410a0
- Horikoshi M., Fujita H., Wang J., Takada R., Roeder R.G. (1991). Nucleotide and amino acid sequence of RAP30. Nucleic Acids Res. 19: 5436—5436. PMID 1840667 DOI:10.1093/nar/19.19.5436
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
- Groft C.M., Uljon S.N., Wang R., Werner M.H. (1998). Structural homology between the Rap30 DNA-binding domain and linker histone H5: implications for preinitiation complex assembly. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9117—9122. PMID 9689043 DOI:10.1073/pnas.95.16.9117
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з General transcription factor IIF subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4653 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P13984 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|