SREBF2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, sterol regulatory element binding transcription factor 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600481 MGI: 107585 HomoloGene: 20966 GeneCards: SREBF2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • C-8 sterol isomerase activity • DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • SREBP-SCAP-Insig complex • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • нуклеоплазма • мітохондрія • внутрішньоклітинна мембранна органела |
---|
Біологічний процес | • steroid metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • lipid metabolism • positive regulation of cholesterol storage • cellular response to laminar fluid shear stress • cellular response to starvation • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of autophagy of mitochondrion • negative regulation of cholesterol efflux • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 41.83 – 41.91 Mb | Хр. 15: 82.03 – 82.09 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SREBF2 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 141 амінокислот, а молекулярна маса — 123 688[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDDSGELGGL | | ETMETLTELG | | DELTLGDIDE | | MLQFVSNQVG | | EFPDLFSEQL |
CSSFPGSGGS | | GSSSGSSGSS | | SSSSNGRGSS | | SGAVDPSVQR | | SFTQVTLPSF |
SPSAASPQAP | | TLQVKVSPTS | | VPTTPRATPI | | LQPRPQPQPQ | | PQTQLQQQTV |
MITPTFSTTP | | QTRIIQQPLI | | YQNAATSFQV | | LQPQVQSLVT | | SSQVQPVTIQ |
QQVQTVQAQR | | VLTQTANGTL | | QTLAPATVQT | | VAAPQVQQVP | | VLVQPQIIKT |
DSLVLTTLKT | | DGSPVMAAVQ | | NPALTALTTP | | IQTAALQVPT | | LVGSSGTILT |
TMPVMMGQEK | | VPIKQVPGGV | | KQLEPPKEGE | | RRTTHNIIEK | | RYRSSINDKI |
IELKDLVMGT | | DAKMHKSGVL | | RKAIDYIKYL | | QQVNHKLRQE | | NMVLKLANQK |
NKLLKGIDLG | | SLVDNEVDLK | | IEDFNQNVLL | | MSPPASDSGS | | QAGFSPYSID |
SEPGSPLLDD | | AKVKDEPDSP | | PVALGMVDRS | | RILLCVLTFL | | CLSFNPLTSL |
LQWGGAHDSD | | QHPHSGSGRS | | VLSFESGSGG | | WFDWMMPTLL | | LWLVNGVIVL |
SVFVKLLVHG | | EPVIRPHSRS | | SVTFWRHRKQ | | ADLDLARGDF | | AAAAGNLQTC |
LAVLGRALPT | | SRLDLACSLS | | WNVIRYSLQK | | LRLVRWLLKK | | VFQCRRATPA |
TEAGFEDEAK | | TSARDAALAY | | HRLHQLHITG | | KLPAGSACSD | | VHMALCAVNL |
AECAEEKIPP | | STLVEIHLTA | | AMGLKTRCGG | | KLGFLASYFL | | SRAQSLCGPE |
HSAVPDSLRW | | LCHPLGQKFF | | MERSWSVKSA | | AKESLYCAQR | | NPADPIAQVH |
QAFCKNLLER | | AIESLVKPQA | | KKKAGDQEEE | | SCEFSSALEY | | LKLLHSFVDS |
VGVMSPPLSR | | SSVLKSALGP | | DIICRWWTSA | | ITVAISWLQG | | DDAAVRSHFT |
KVERIPKALE | | VTESPLVKAI | | FHACRAMHAS | | LPGKADGQQS | | SFCHCERASG |
HLWSSLNVSG | | ATSDPALNHV | | VQLLTCDLLL | | SLRTALWQKQ | | ASASQAVGET |
YHASGAELAG | | FQRDLGSLRR | | LAHSFRPAYR | | KVFLHEATVR | | LMAGASPTRT |
HQLLEHSLRR | | RTTQSTKHGE | | VDAWPGQRER | | ATAILLACRH | | LPLSFLSSPG |
QRAVLLAEAA | | RTLEKVGDRR | | SCNDCQQMIV | | KLGGGTAIAA | | S |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
- Pai J.-T., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Purification and cDNA cloning of a second apoptosis-related cysteine protease that cleaves and activates sterol regulatory element binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 5437—5442. PMID 8643593 DOI:10.1073/pnas.93.11.5437
- Duncan E.A., Dave U.P., Sakai J., Goldstein J.L., Brown M.S. (1998). Second-site cleavage in sterol regulatory element-binding protein occurs at transmembrane junction as determined by cysteine panning. J. Biol. Chem. 273: 17801—17809. PMID 9651382 DOI:10.1074/jbc.273.28.17801
- Ye J., Dave U.P., Grishin N.V., Goldstein J.L., Brown M.S. (2000). Asparagine-proline sequence within membrane-spanning segment of SREBP triggers intramembrane cleavage by site-2 protease. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 5123—5128. PMID 10805775 DOI:10.1073/pnas.97.10.5123
- Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11290 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12772 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|