ZNF346 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MKD, 2MKN | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF346, JAZ, Zfp346, zinc finger protein 346 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605308 MGI: 1349417 HomoloGene: 8073 GeneCards: ZNF346 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • enzyme binding • double-stranded RNA binding • zinc ion binding • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding • miRNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of apoptotic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001308213 NM_001308214 NM_001308215 NM_001308216 NM_001308218
| NM_001308219 NM_001308221 NM_001308223 NM_012279 NM_001363713 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001295142 NP_001295143 NP_001295144 NP_001295145 NP_001295147
| NP_001295148 NP_001295150 NP_001295152 NP_036411 NP_001350642 |
| | NP_036147 NP_001365863 NP_001365864 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 177.02 – 177.08 Mb | Хр. 13: 55.11 – 55.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF346 (англ. Zinc finger protein 346) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 294 амінокислот, а молекулярна маса — 32 933[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEYPAPATVQ | | AADGGAAGPY | | SSSELLEGQE | | PDGVRFDRER | | ARRLWEAVSG |
AQPVGREEVE | | HMIQKNQCLF | | TNTQCKVCCA | | LLISESQKLA | | HYQSKKHANK |
VKRYLAIHGM | | ETLKGETKKL | | DSDQKSSRSK | | DKNQCCPICN | | MTFSSPVVAQ |
SHYLGKTHAK | | NLKLKQQSTK | | VEALHQNREM | | IDPDKFCSLC | | HATFNDPVMA |
QQHYVGKKHR | | KQETKLKLMA | | RYGRLADPAV | | TDFPAGKGYP | | CKTCKIVLNS |
IEQYQAHVSG | | FKHKNQSPKT | | VASSLGQIPM | | QRQPIQKDST | | TLED |
Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Yang M., May W.S., Ito T. (1999). JAZ requires the double-stranded RNA-binding zinc finger motifs for nuclear localization. J. Biol. Chem. 274: 27399—27406. PMID 10488071 DOI:10.1074/jbc.274.39.27399
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5. Mol. Cell. Biol. 24: 6608—6619. PMID 15254228 DOI:10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
- Burge R.G., Martinez-Yamout M.A., Dyson H.J., Wright P.E. (2014). Structural characterization of interactions between the double-stranded RNA-binding zinc finger protein JAZ and nucleic acids. Biochemistry. 53: 1495—1510. PMID 24521053 DOI:10.1021/bi401675h
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16403 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UL40 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|