ZEB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2E19

Ідентифікатори

Символи

ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A

Зовнішні ІД

OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1

Пов'язані генетичні захворювання

Fuchs' endothelial dystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • transcription factor binding • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• transcription regulator complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• pattern specification process • embryonic skeletal system morphogenesis • regulation of smooth muscle cell differentiation • animal organ development • диференціація клітин • semicircular canal morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • regulation of T cell differentiation in thymus • central nervous system development • cartilage development • regulation of mesenchymal cell proliferation • embryonic camera-type eye morphogenesis • cochlea morphogenesis • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • embryonic morphogenesis • cellular response to amino acid stimulus • проліферація • negative regulation of epithelial cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of neuron differentiation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of endothelial cell differentiation • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6935


21417

Ensembl


ENSG00000148516


ENSMUSG00000024238

UniProt


P37275


Q64318

RefSeq (мРНК)

NM_001128128
NM_001174093
NM_001174094
NM_001174095
NM_001174096

NM_030751
NM_001323638
NM_001323641
NM_001323642
NM_001323643
NM_001323644
NM_001323645
NM_001323646
NM_001323647
NM_001323648
NM_001323649
NM_001323650
NM_001323651
NM_001323652
NM_001323653
NM_001323654
NM_001323655
NM_001323656
NM_001323657
NM_001323658
NM_001323659
NM_001323660
NM_001323661
NM_001323662
NM_001323663
NM_001323664
NM_001323665
NM_001323666
NM_001323671
NM_001323672
NM_001323673
NM_001323674
NM_001323675
NM_001323676
NM_001323677
NM_001323678


NM_011546 NM_001360981 NM_001360982

RefSeq (білок)

NP_001121600
NP_001167564
NP_001167565
NP_001167566
NP_001167567

NP_001310567
NP_001310570
NP_001310571
NP_001310572
NP_001310573
NP_001310574
NP_001310575
NP_001310576
NP_001310577
NP_001310578
NP_001310579
NP_001310580
NP_001310581
NP_001310582
NP_001310583
NP_001310584
NP_001310585
NP_001310586
NP_001310587
NP_001310588
NP_001310589
NP_001310590
NP_001310591
NP_001310592
NP_001310593
NP_001310594
NP_001310595
NP_001310600
NP_001310601
NP_001310602
NP_001310603
NP_001310604
NP_001310605
NP_001310606
NP_001310607
NP_110378


NP_035676 NP_001347910 NP_001347911

Локус (UCSC)

Хр. 10: 31.32 – 31.53 Mb

Хр. 18: 5.59 – 5.78 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADGPRCKRR	KQANPRRNNV	TNYNTVVETN	SDSDDEDKLH	IVEEESVTDA
ADCEGVPEDD	LPTDQTVLPG	RSSEREGNAK	NCWEDDRKEG	QEILGPEAQA
DEAGCTVKDD	ECESDAENEQ	NHDPNVEEFL	QQQDTAVIFP	EAPEEDQRQG
TPEASGHDEN	GTPDAFSQLL	TCPYCDRGYK	RFTSLKEHIK	YRHEKNEDNF
SCSLCSYTFA	YRTQLERHMT	SHKSGRDQRH	VTQSGCNRKF	KCTECGKAFK
YKHHLKEHLR	IHSGEKPYEC	PNCKKRFSHS	GSYSSHISSK	KCISLIPVNG
RPRTGLKTSQ	CSSPSLSASP	GSPTRPQIRQ	KIENKPLQEQ	LSVNQIKTEP
VDYEFKPIVV	ASGINCSTPL	QNGVFTGGGP	LQATSSPQGM	VQAVVLPTVG
LVSPISINLS	DIQNVLKVAV	DGNVIRQVLE	NNQANLASKE	QETINASPIQ
QGGHSVISAI	SLPLVDQDGT	TKIIINYSLE	QPSQLQVVPQ	NLKKENPVAT
NSCKSEKLPE	DLTVKSEKDK	SFEGGVNDST	CLLCDDCPGD	INALPELKHY
DLKQPTQPPP	LPAAEAEKPE	SSVSSATGDG	NLSPSQPPLK	NLLSLLKAYY
ALNAQPSAEE	LSKIADSVNL	PLDVVKKWFE	KMQAGQISVQ	SSEPSSPEPG
KVNIPAKNND	QPQSANANEP	QDSTVNLQSP	LKMTNSPVLP	VGSTTNGSRS
STPSPSPLNL	SSSRNTQGYL	YTAEGAQEEP	QVEPLDLSLP	KQQGELLERS
TITSVYQNSV	YSVQEEPLNL	SCAKKEPQKD	SCVTDSEPVV	NVIPPSANPI
NIAIPTVTAQ	LPTIVAIADQ	NSVPCLRALA	ANKQTILIPQ	VAYTYSTTVS
PAVQEPPLKV	IQPNGNQDER	QDTSSEGVSN	VEDQNDSDST	PPKKKMRKTE
NGMYACDLCD	KIFQKSSSLL	RHKYEHTGKR	PHECGICKKA	FKHKHHLIEH
MRLHSGEKPY	QCDKCGKRFS	HSGSYSQHMN	HRYSYCKREA	EERDSTEQEE
AGPEILSNEH	VGARASPSQG	DSDERESLTR	EEDEDSEKEE	EEEDKEMEEL
QEEKECEKPQ	GDEEEEEEEE	EVEEEEVEEA	ENEGEEAKTE	GLMKDDRAES
QASSLGQKVG	ESSEQVSEEK	TNEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus. Biochem. J. 427: 541—550. PMID 20175752 DOI:10.1042/BJ20091578
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159—6166. PMID 25190660 DOI:10.1167/iovs.14-15247

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZEB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P37275 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма