CCR5

CCR5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2L87, 2RLL, 2RRS, 2MZX, 4MBS

Ідентифікатори
Символи CCR5, CC-CKR-5, CCCKR5, CCR-5, CD195, CKR-5, CKR5, CMKBR5, IDDM22, C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene), C-C motif chemokine receptor 5
Зовнішні ІД OMIM: 601373 MGI: 107182 HomoloGene: 37325 GeneCards: CCR5
Пов'язані генетичні захворювання
type 1 diabetes mellitus 22, ВІЛ-заворювання[1]
Реагує на сполуку
aplaviroc, ценікрівірок, маравірок, vicriviroc, aplaviroc hydrochloride, AZD5672[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• G protein-coupled receptor activity
• coreceptor activity
• chemokine (C-C motif) ligand 5 binding
• virus receptor activity
• signal transducer activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• chemokine receptor activity
• C-C chemokine receptor activity
• actin binding
• phosphatidylinositol phospholipase C activity
• C-C chemokine binding
• chemokine binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• ендосома
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• external side of plasma membrane
• cell surface

Біологічний процес

• G protein-coupled receptor signaling pathway
• signaling
• response to cholesterol
• release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• cell-cell signaling
• dendritic cell chemotaxis
• MAPK cascade
• хемотаксис
• cellular defense response
• cell surface receptor signaling pathway
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• inflammatory response
• cellular response to lipopolysaccharide
• calcium ion transport
• calcium-mediated signaling
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• fusion of virus membrane with host plasma membrane
• chemokine-mediated signaling pathway
• GO:0022415 viral process
• defense response
• negative regulation of macrophage apoptotic process
• cytokine-mediated signaling pathway
• cell chemotaxis

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1234
12774
Ensembl
ENSG00000160791
ENSMUSG00000079227
UniProt
P51681
P51682
RefSeq (мРНК)
NM_001100168
NM_000579
NM_001394783
NM_009917
RefSeq (білок)
NP_000570
NP_001093638
NP_034047
Локус (UCSC) Хр. 3: 46.37 – 46.38 Mb Хр. 9: 123.92 – 123.95 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CCR5 (англ. C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 524[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNML
VILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTM
CQLLTGLYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSV
ITWVVAVFASLPGIIFTRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVI
LGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAP
YNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFV
GEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEISV
GL

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Samson M., Labbe O., Mollereau C., Vassart G., Parmentier M. (1996). Molecular cloning and functional expression of a new human CC-chemokine receptor gene. Biochemistry. 35: 3362—3367. PMID 8639485 DOI:10.1021/bi952950g
  • Raport C.J., Gosling J., Schweichart V.L., Gray P.W., Charo I.F. (1996). Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor (CCR5) for RANTES, MIP-1beta, and MIP-1alpha. J. Biol. Chem. 271: 17161—17166. PMID 8663314 DOI:10.1074/jbc.271.29.17161
  • Mummidi S., Ahuja S.S., McDaniel B.L., Ahuja S.K. (1997). The human CC chemokine receptor 5 (CCR5) gene. Multiple transcripts with 5'-end heterogeneity, dual promoter usage, and evidence for polymorphisms within the regulatory regions and noncoding exons. J. Biol. Chem. 272: 30662—30671. PMID 9388201 DOI:10.1074/jbc.272.49.30662
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Oppermann M., Mack M., Proudfoot A.E., Olbrich H. (1999). Differential effects of CC chemokines on CC chemokine receptor 5 (CCR5) phosphorylation and identification of phosphorylation sites on the CCR5 carboxyl terminus. J. Biol. Chem. 274: 8875—8885. PMID 10085131 DOI:10.1074/jbc.274.13.8875
  • Schweneker M., Bachmann A.S., Moelling K. (2005). JM4 is a four-transmembrane protein binding to the CCR5 receptor. FEBS Lett. 579: 1751—1758. PMID 15757671 DOI:10.1016/j.febslet.2005.02.037

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1606 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  6. ↑ UniProt, P51681 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350