LRP1

LRP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1CR8, 1D2L, 1J8E, 2FYJ, 2FYL, 2KNX, 2KNY

Ідентифікатори
Символи LRP1, A2MR, APOER, APR, CD91, IGFBP3R, LRP, LRP1A, TGFBR5, low density lipoprotein receptor-related protein 1, LDL receptor related protein 1, KPA, IGFBP3R1, IGFBP-3R
Зовнішні ІД OMIM: 107770 MGI: 96828 HomoloGene: 1744 GeneCards: LRP1
Пов'язані генетичні захворювання
мігрень, migraine without aura, Аневризма черевної аорти[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• apolipoprotein binding
• lipoprotein particle receptor binding
• GO:0032403 protein-containing complex binding
• зв'язування з іоном металу
• protease binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• low-density lipoprotein particle receptor activity
• RNA binding
• amyloid-beta binding
• scavenger receptor activity
• coreceptor activity
• alpha-2 macroglobulin receptor activity
• apolipoprotein receptor activity
• clathrin heavy chain binding
• signaling receptor activity
• cargo receptor activity
• heparan sulfate proteoglycan binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• endocytic vesicle membrane
• ендосома
• мембрана
• focal adhesion
• receptor complex
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• lysosomal membrane
• neuronal cell body
• дендрит (нейробіологія)
• ядерце
• clathrin-coated pit
• clathrin-coated vesicle
• клітинне ядро
• цитоплазма
• гіалоплазма
• early endosome
• basolateral plasma membrane
• insulin-responsive compartment
• axonal growth cone
• apical part of cell
• plasma membrane protein complex

Біологічний процес

• lipoprotein metabolic process
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
• negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway
• negative regulation of neuron projection development
• ендоцитоз
• regulation of actin cytoskeleton organization
• regulation of phospholipase A2 activity
• amyloid-beta clearance
• negative regulation of Wnt signaling pathway
• GO:0010260 старіння людини
• negative regulation of smooth muscle cell migration
• positive regulation of lipid transport
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• aorta morphogenesis
• retinoid metabolic process
• regulation of cholesterol transport
• positive regulation of protein transport
• apoptotic cell clearance
• multicellular organism development
• protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway
• positive regulation of cholesterol efflux
• cerebral cortex development
• проліферація
• lipoprotein transport
• regulation of extracellular matrix disassembly
• astrocyte activation involved in immune response
• lipid metabolism
• Фагоцитоз
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• negative regulation of cell-substrate adhesion
• positive regulation of cell death
• positive regulation of neuron projection development
• receptor internalization
• positive regulation of protein binding
• positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus
• negative regulation of apoptotic process
• cellular lipid catabolic process
• Цитопемпсис
• positive regulation of axon extension
• positive regulation of endocytosis
• positive regulation of axon extension involved in regeneration
• positive regulation of collateral sprouting of injured axon
• positive regulation of phagocytosis
• negative regulation of cytosolic calcium ion concentration
• negative regulation of focal adhesion assembly
• negative regulation of cell death
• chemoattraction of axon
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• amyloid-beta clearance by transcytosis
• amyloid-beta clearance by cellular catabolic process
• positive regulation of Schwann cell migration
• positive regulation of amyloid-beta clearance
• positive regulation of protein localization to plasma membrane
• positive regulation of cholesterol import
• cellular response to amyloid-beta
• positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration
• positive regulation of lysosomal protein catabolic process
• lysosomal transport

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4035
16971
Ensembl
ENSG00000123384
ENSMUSG00000040249
UniProt
Q07954
Q91ZX7
RefSeq (мРНК)
NM_002332
NM_008512
RefSeq (білок)
NP_002323
NP_032538
Локус (UCSC) Хр. 12: 57.13 – 57.21 Mb Хр. 10: 127.37 – 127.46 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLTPPLLLLLPLLSALVAAAIDAPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGE
RDCPDGSDEAPEICPQSKAQRCQPNEHNCLGTELCVPMSRLCNGVQDCMD
GSDEGPHCRELQGNCSRLGCQHHCVPTLDGPTCYCNSSFQLQADGKTCKD
FDECSVYGTCSQLCTNTDGSFICGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEPVDRPPV
LLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQTTAMDFSYANETVCWVHVGDS
AAQTQLKCARMPGLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWLTGNFYFVDDI
DDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYNPKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVER
CDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLDYIEVVDYEGKG
RQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANAQQKTSVIRVNRFNSTEY
QVVTRVDKGGALHIYHQRRQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHK
ARTCRCRSGFSLGSDGKSCKKPEHELFLVYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDE
HMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIGRQKIDGTERETILKDG
IHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTHP
RAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLW
PNGLSLDIPAGRLYWVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCH
HGNYLFWTEYRSGSVYRLERGVGGAPPTVTLLRSERPPIFEIRMYDAQQQ
QVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSRQCACAEDQVLDADGVTCLANPSYVP
PPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQHTCPSDRF
KCENNRCIPNRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIP
ISWTCDLDDDCGDRSDESASCAYPTCFPLTQFTCNNGRCININWRCDNDN
DCGDNSDEAGCSHSCSSTQFKCNSGRCIPEHWTCDGDNDCGDYSDETHAN
CTNQATRPPGGCHTDEFQCRLDGLCIPLRWRCDGDTDCMDSSDEKSCEGV
THVCDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDGDNDCEDNSDEENCESLACRPPSH
PCANNTSVCLPPDKLCDGNDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNCSVAP
GEGIVCSCPLGMELGPDNHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYE
GWVLEPDGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRIDLHKGDYSVLVPGLRNTI
ALDFHLSQSALYWTDVVEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLATPEGLA
VDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGTLRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGI
LFWTDWDASLPRIEAASMSGAGRRTVHRETGSGGWPNGLTVDYLEKRILW
IDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEFLSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNT
LAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEANGGQGPCS
HLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDA
PYYNYIISFTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVE
TVVSADLPNAHGLAVDWVSRNLFWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQG
LEQPHGLVVHPLRGKLYWTDGDNISMANMDGSNRTLLFSGQKGPVGLAID
FPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSGLEVIDAMRSQLGKATALAIMGDKLW
WADQVSEKMGTCSKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLDHKGTNPC
SVNNGDCSQLCLPTSETTRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEG
IRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAENDTIYWVDMGLSTISRAK
RDQTWREDVVTNGIGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGSFRY
VVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVS
ISWPNGISVDYQDGKLYWCDARTDKIERIDLETGENREVVLSSNNMDMFS
VSVFEDFIYWSDRTHANGSIKRGSKDNATDSVPLRTGIGVQLKDIKVFNR
DRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACACAHGMLAEDGASCREYAGY
LLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPG
TPNRIFFSDIHFGNIQQINDDGSRRITIVENVGSVEGLAYHRGWDTLYWT
SYTTSTITRHTVDQTRPGAFERETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTN
WNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDK
IERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKHVG
SNMKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGH
VNCSCRGGRILQDDLTCRAVNSSCRAQDEFECANGECINFSLTCDGVPHC
KDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPC
NKTACGVGEFRCRDGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRL
GVKGVLFQPCERTSLCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNY
FACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGEDETHCNKFCSEAQFECQNHRCISKQ
WLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPSSFSCPGTHVCVPERWLCDGDKDC
ADGADESIAAGCLYNSTCDDREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCADGSDES
PECEYPTCGPSEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQ
EHKCNASSQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDERGCHINECLSRKLS
GCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFRLKDDGRTCADVDECSTTFPCSQRCINTH
GSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNYT
LLKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTG
LSNPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRAL
VVDVQNGYLYWTDWGDHSLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYVT
ERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVYWTDWE
TKSINRAHKTTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVNNGG
CSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGSDGRTCVSNCTASQFVCKNDKCIPFW
WKCDTEDDCGDHSDEPPDCPEFKCRPGQFQCSTGICTNPAFICDGDNDCQ
DNSDEANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCIPGIFRCNGQDNCGDGEDERDCPE
VTCAPNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDEPANCTQMTCGVDEFR
CKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVP
GRWQCDYDNDCGDNSDEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAGRWKCDGDHDC
ADGSDEKDCTPRCDMDQFQCKSGHCIPLRWRCDADADCMDGSDEEACGTG
VRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGEDDCGDNSDENPEECARFVCPPNRP
FRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGDGTDEEDCEPPTAHTTHCKDKKEFLCR
NQRCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSIDPKLTSCATNASICGDEARCVR
TEKAAYCACRSGFHTVPGQPGCQDINECLRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCA
RNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLFPGHPHSAYEQAFQGDESV
RIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDRGVT
HLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMI
DEPHAIVVDPLRGTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGL
AVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGTDPIVAADSKRGLSHPFSIDVFED
YIYGVTYINNRVFKIHKFGHSPLVNLTGGLSHASDVVLYHQHKQPEVTNP
CDRKKCEWLCLLSPSGPVCTCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPRPGTC
NLQCFNGGSCFLNARRQPKCRCQPRYTGDKCELDQCWEHCRNGGTCAASP
SGMPTCRCPTGFTGPKCTQQVCAGYCANNSTCTVNQGNQPQCRCLPGFLG
DRCQYRQCSGYCENFGTCQMAADGSRQCRCTAYFEGSRCEVNKCSRCLEG
ACVVNKQSGDVTCNCTDGRVAPSCLTCVGHCSNGGSCTMNSKMMPECQCP
PHMTGPRCEEHVFSQQQPGHIASILIPLLLLLLLVLVAGVVFWYKRRVQG
AKGFQHQRMTNGAMNVEIGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFALDPDKPT
NFTNPVYATLYMGGHGSRHSLASTDEKRELLGRGPEDEIGDPLA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

  • Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms. Genomics. 52: 138—144. PMID 9782078 DOI:10.1006/geno.1998.5408
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain. J. Biol. Chem. 277: 18736—18743. PMID 11907044 DOI:10.1074/jbc.M201979200
  • Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65. J. Biol. Chem. 278: 41182—41188. PMID 12888553 DOI:10.1074/jbc.M306403200
  • May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment. Traffic. 4: 291—301. PMID 12713657 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
  • Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein. J. Biol. Chem. 274: 14130—14136. PMID 10318830 DOI:10.1074/jbc.274.20.14130

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q07954 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2008. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350