PTPRJ

PTPRJ
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2CFV, 2DLE, 2NZ6

Ідентифікатори
Символи PTPRJ, CD148, DEP1, HPTPeta, R-PTP-ETA, SCC1, protein tyrosine phosphatase, receptor type J, protein tyrosine phosphatase receptor type J, R-PTP-J, HPTP eta
Зовнішні ІД OMIM: 600925 MGI: 104574 HomoloGene: 2130 GeneCards: PTPRJ
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

beta-catenin binding
phosphoprotein phosphatase activity
gamma-catenin binding
GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity
delta-catenin binding
mitogen-activated protein kinase binding
platelet-derived growth factor receptor binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
hydrolase activity
protein kinase binding
protein tyrosine phosphatase activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
cell projection
мембрана
cell-cell junction
клітинна мембрана
integral component of plasma membrane
ruffle membrane
cell surface
міжклітинні контакти
immunological synapse
екзосома
specific granule membrane

Біологічний процес

negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
negative regulation of protein kinase B signaling
positive regulation of protein kinase B signaling
negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway
GO:0016576 protein dephosphorylation
contact inhibition
negative regulation of T cell receptor signaling pathway
regulation of cell adhesion
negative regulation of cell migration
negative regulation of MAP kinase activity
negative regulation of cell growth
positive regulation of focal adhesion assembly
platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
positive chemotaxis
peptidyl-tyrosine dephosphorylation
T cell receptor signaling pathway
negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of vascular permeability
positive regulation of cell adhesion
GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання
neutrophil degranulation
B cell differentiation
positive regulation of tumor necrosis factor production
calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
positive regulation of MAPK cascade
positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
positive regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5795
19271
Ensembl
ENSG00000149177
ENSMUSG00000025314
UniProt
Q12913
Q64455
RefSeq (мРНК)
NM_001098503
NM_002843
NM_001135657
NM_008982
RefSeq (білок)
NP_001091973
NP_002834
NP_001129129
NP_033008
Локус (UCSC) Хр. 11: 47.98 – 48.17 Mb Хр. 2: 90.26 – 90.41 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PTPRJ (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 337 амінокислот, а молекулярна маса — 145 941[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKPAAREARLPPRSPGLRWALPLLLLLLRLGQILCAGGTPSPIPDPSVAT
VATGENGITQISSTAESFHKQNGTGTPQVETNTSEDGESSGANDSLRTPE
QGSNGTDGASQKTPSSTGPSPVFDIKAVSISPTNVILTWKSNDTAASEYK
YVVKHKMENEKTITVVHQPWCNITGLRPATSYVFSITPGIGNETWGDPRV
IKVITEPIPVSDLRVALTGVRKAALSWSNGNGTASCRVLLESIGSHEELT
QDSRLQVNISGLKPGVQYNINPYLLQSNKTKGDPLGTEGGLDASNTERSR
AGSPTAPVHDESLVGPVDPSSGQQSRDTEVLLVGLEPGTRYNATVYSQAA
NGTEGQPQAIEFRTNAIQVFDVTAVNISATSLTLIWKVSDNESSSNYTYK
IHVAGETDSSNLNVSEPRAVIPGLRSSTFYNITVCPVLGDIEGTPGFLQV
HTPPVPVSDFRVTVVSTTEIGLAWSSHDAESFQMHITQEGAGNSRVEITT
NQSIIIGGLFPGTKYCFEIVPKGPNGTEGASRTVCNRTVPSAVFDIHVVY
VTTTEMWLDWKSPDGASEYVYHLVIESKHGSNHTSTYDKAITLQGLIPGT
LYNITISPEVDHVWGDPNSTAQYTRPSNVSNIDVSTNTTAATLSWQNFDD
ASPTYSYCLLIEKAGNSSNATQVVTDIGITDATVTELIPGSSYTVEIFAQ
VGDGIKSLEPGRKSFCTDPASMASFDCEVVPKEPALVLKWTCPPGANAGF
ELEVSSGAWNNATHLESCSSENGTEYRTEVTYLNFSTSYNISITTVSCGK
MAAPTRNTCTTGITDPPPPDGSPNITSVSHNSVKVKFSGFEASHGPIKAY
AVILTTGEAGHPSADVLKYTYEDFKKGASDTYVTYLIRTEEKGRSQSLSE
VLKYEIDVGNESTTLGYYNGKLEPLGSYRACVAGFTNITFHPQNKGLIDG
AESYVSFSRYSDAVSLPQDPGVICGAVFGCIFGALVIVTVGGFIFWRKKR
KDAKNNEVSFSQIKPKKSKLIRVENFEAYFKKQQADSNCGFAEEYEDLKL
VGISQPKYAAELAENRGKNRYNNVLPYDISRVKLSVQTHSTDDYINANYM
PGYHSKKDFIATQGPLPNTLKDFWRMVWEKNVYAIIMLTKCVEQGRTKCE
EYWPSKQAQDYGDITVAMTSEIVLPEWTIRDFTVKNIQTSESHPLRQFHF
TSWPDHGVPDTTDLLINFRYLVRDYMKQSPPESPILVHCSAGVGRTGTFI
AIDRLIYQIENENTVDVYGIVYDLRMHRPLMVQTEDQYVFLNQCVLDIVR
SQKDSKVDLIYQNTTAMTIYENLAPVTTFGKTNGYIA

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

  • Oestman A., Yang Q., Tonks N.K. (1994). Expression of DEP-1, a receptor-like protein-tyrosine-phosphatase, is enhanced with increasing cell density. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 9680—9684. PMID 7937872 DOI:10.1073/pnas.91.21.9680
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Baker J.E., Majeti R., Tangye S.G., Weiss A. (2001). Protein tyrosine phosphatase CD148-mediated inhibition of T-cell receptor signal transduction is associated with reduced LAT and phospholipase Cgamma1 phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 21: 2393—2403. PMID 11259588 DOI:10.1128/MCB.21.7.2393-2403.2001
  • Persson C., Engstrom U., Mowbray S.L., Ostman A. (2002). Primary sequence determinants responsible for site-selective dephosphorylation of the PDGF beta-receptor by the receptor-like protein tyrosine phosphatase DEP-1. FEBS Lett. 517: 27—31. PMID 12062403 DOI:10.1016/S0014-5793(02)02570-X
  • Holsinger L.J., Ward K., Duffield B., Zachwieja J., Jallal B. (2002). The transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase DEP1 interacts with p120(ctn). Oncogene. 21: 7067—7076. PMID 12370829 DOI:10.1038/sj.onc.1205858
  • Palka H.L., Park M., Tonks N.K. (2003). Hepatocyte growth factor receptor tyrosine kinase met is a substrate of the receptor protein-tyrosine phosphatase DEP-1. J. Biol. Chem. 278: 5728—5735. PMID 12475979 DOI:10.1074/jbc.M210656200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з PTPRJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9673 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, Q12913 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350