TLR3

TLR3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1ZIW, 2A0Z, 3ULU, 3ULV, 2MK9, 2MKA

Ідентифікатори
Символи TLR3, CD283, IIAE2, toll like receptor 3, IMD83
Зовнішні ІД OMIM: 603029 MGI: 2156367 HomoloGene: 20696 GeneCards: TLR3
Пов'язані генетичні захворювання
herpesviral encephalitis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• RNA binding
• double-stranded RNA binding
• transmembrane signaling receptor activity
• signaling receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• ендосома
• endoplasmic reticulum membrane
• мембрана
• Golgi membrane
• integral component of plasma membrane
• внутрішньоклітинний
• cell surface
• lysosomal membrane
• early endosome
• ендоплазматичний ретикулум
• endolysosome membrane
• endosome membrane
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця

Біологічний процес

• positive regulation of interferon-beta production
• response to dsRNA
• defense response
• positive regulation of toll-like receptor signaling pathway
• positive regulation of protein phosphorylation
• male gonad development
• positive regulation of inflammatory response
• positive regulation of interleukin-12 production
• positive regulation of type III interferon production
• cellular response to interferon-beta
• response to exogenous dsRNA
• negative regulation of osteoclast differentiation
• GO:0032737 positive regulation of cytokine production
• процес імунної системи
• response to virus
• activation of NF-kappaB-inducing kinase activity
• I-kappaB phosphorylation
• positive regulation of JNK cascade
• hyperosmotic response
• cellular response to dsRNA
• regulation of dendritic cell cytokine production
• microglial cell activation
• toll-like receptor signaling pathway
• TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
• cellular response to mechanical stimulus
• microglial cell activation involved in immune response
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• defense response to bacterium
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• defense response to virus
• necroptotic signaling pathway
• positive regulation of interleukin-8 production
• cellular response to exogenous dsRNA
• positive regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of tumor necrosis factor production
• cellular response to interferon-gamma
• positive regulation of chemokine production
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• detection of virus
• inflammatory response
• вроджений імунітет
• I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• toll-like receptor 3 signaling pathway
• positive regulation of type I interferon production
• MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз
• apoptotic signaling pathway
• negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• extrinsic apoptotic signaling pathway
• positive regulation of angiogenesis
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7098
142980
Ensembl
ENSG00000164342
ENSMUSG00000031639
UniProt
O15455
Q99MB1
RefSeq (мРНК)
NM_003265
NM_126166
NM_001357316
NM_001357317
RefSeq (білок)
NP_003256
NP_569054
NP_001344245
NP_001344246
Локус (UCSC) Хр. 4: 186.07 – 186.09 Mb Хр. 8: 45.85 – 45.86 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TLR3 (англ. Toll like receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 904 амінокислот, а молекулярна маса — 103 829[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRQTLPCIYFWGGLLPFGMLCASSTTKCTVSHEVADCSHLKLTQVPDDLP
TNITVLNLTHNQLRRLPAANFTRYSQLTSLDVGFNTISKLEPELCQKLPM
LKVLNLQHNELSQLSDKTFAFCTNLTELHLMSNSIQKIKNNPFVKQKNLI
TLDLSHNGLSSTKLGTQVQLENLQELLLSNNKIQALKSEELDIFANSSLK
KLELSSNQIKEFSPGCFHAIGRLFGLFLNNVQLGPSLTEKLCLELANTSI
RNLSLSNSQLSTTSNTTFLGLKWTNLTMLDLSYNNLNVVGNDSFAWLPQL
EYFFLEYNNIQHLFSHSLHGLFNVRYLNLKRSFTKQSISLASLPKIDDFS
FQWLKCLEHLNMEDNDIPGIKSNMFTGLINLKYLSLSNSFTSLRTLTNET
FVSLAHSPLHILNLTKNKISKIESDAFSWLGHLEVLDLGLNEIGQELTGQ
EWRGLENIFEIYLSYNKYLQLTRNSFALVPSLQRLMLRRVALKNVDSSPS
PFQPLRNLTILDLSNNNIANINDDMLEGLEKLEILDLQHNNLARLWKHAN
PGGPIYFLKGLSHLHILNLESNGFDEIPVEVFKDLFELKIIDLGLNNLNT
LPASVFNNQVSLKSLNLQKNLITSVEKKVFGPAFRNLTELDMRFNPFDCT
CESIAWFVNWINETHTNIPELSSHYLCNTPPHYHGFPVRLFDTSSCKDSA
PFELFFMINTSILLIFIFIVLLIHFEGWRISFYWNVSVHRVLGFKEIDRQ
TEQFEYAAYIIHAYKDKDWVWEHFSSMEKEDQSLKFCLEERDFEAGVFEL
EAIVNSIKRSRKIIFVITHHLLKDPLCKRFKVHHAVQQAIEQNLDSIILV
FLEEIPDYKLNHALCLRRGMFKSHCILNWPVQKERIGAFRHKLQVALGSK
NSVH

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ендосомах.

Література

  • Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 DOI:10.1073/pnas.95.2.588
  • Lafon M., Megret F., Lafage M., Prehaud C. (2006). The innate immune facet of brain: human neurons express TLR-3 and sense viral dsRNA. J. Mol. Neurosci. 29: 185—194. PMID 17085778 DOI:10.1385/JMN:29:3:185
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Oshiumi H., Matsumoto M., Funami K., Akazawa T., Seya T. (2003). TICAM-1, an adapter molecule that participates in Toll-like receptor 3 mediated interferon-beta induction. Nat. Immunol. 4: 161—167. PMID 12539043 DOI:10.1038/ni886
  • Bell J.K., Askins J., Hall P.R., Davies D.R., Segal D.M. (2006). The dsRNA binding site of human Toll-like receptor 3. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 8792—8797. PMID 16720699 DOI:10.1073/pnas.0603245103

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TLR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11849 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, O15455 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350