ITGA1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 4A0Q, 2M32 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGA1, CD49a, VLA1, integrin subunit alpha 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 192968 MGI: 96599 HomoloGene: 57137 GeneCards: ITGA1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • collagen binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding involved in cell-matrix adhesion • protein phosphatase binding • signaling receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • перикаріон • integrin alpha1-beta1 complex • мембрана • focal adhesion • basal part of cell • клітинна мембрана • cell surface • integrin complex • Акросома • membrane raft • neuron projection • екзосома • external side of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • neuron projection morphogenesis • м'язове скорочення • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • extracellular matrix organization • вазодилатація • neutrophil chemotaxis • positive regulation of neuron apoptotic process • positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity • адгезія клітин • cell chemotaxis • integrin-mediated signaling pathway • cellular extravasation • cell-matrix adhesion • negative regulation of cell population proliferation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 52.79 – 52.96 Mb | Хр. 13: 115.09 – 115.24 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITGA1 (англ. Integrin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 179 амінокислот, а молекулярна маса — 130 848[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPRPRARPG | | VAVACCWLLT | | VVLRCCVSFN | | VDVKNSMTFS | | GPVEDMFGYT |
VQQYENEEGK | | WVLIGSPLVG | | QPKNRTGDVY | | KCPVGRGESL | | PCVKLDLPVN |
TSIPNVTEVK | | ENMTFGSTLV | | TNPNGGFLAC | | GPLYAYRCGH | | LHYTTGICSD |
VSPTFQVVNS | | IAPVQECSTQ | | LDIVIVLDGS | | NSIYPWDSVT | | AFLNDLLERM |
DIGPKQTQVG | | IVQYGENVTH | | EFNLNKYSST | | EEVLVAAKKI | | VQRGGRQTMT |
ALGIDTARKE | | AFTEARGARR | | GVKKVMVIVT | | DGESHDNHRL | | KKVIQDCEDE |
NIQRFSIAIL | | GSYNRGNLST | | EKFVEEIKSI | | ASEPTEKHFF | | NVSDELALVT |
IVKTLGERIF | | ALEATADQSA | | ASFEMEMSQT | | GFSAHYSQDW | | VMLGAVGAYD |
WNGTVVMQKA | | SQIIIPRNTT | | FNVESTKKNE | | PLASYLGYTV | | NSATASSGDV |
LYIAGQPRYN | | HTGQVIIYRM | | EDGNIKILQT | | LSGEQIGSYF | | GSILTTTDID |
KDSNTDILLV | | GAPMYMGTEK | | EEQGKVYVYA | | LNQTRFEYQM | | SLEPIKQTCC |
SSRQHNSCTT | | ENKNEPCGAR | | FGTAIAAVKD | | LNLDGFNDIV | | IGAPLEDDHG |
GAVYIYHGSG | | KTIRKEYAQR | | IPSGGDGKTL | | KFFGQSIHGE | | MDLNGDGLTD |
VTIGGLGGAA | | LFWSRDVAVV | | KVTMNFEPNK | | VNIQKKNCHM | | EGKETVCINA |
TVCFDVKLKS | | KEDTIYEADL | | QYRVTLDSLR | | QISRSFFSGT | | QERKVQRNIT |
VRKSECTKHS | | FYMLDKHDFQ | | DSVRITLDFN | | LTDPENGPVL | | DDSLPNSVHE |
YIPFAKDCGN | | KEKCISDLSL | | HVATTEKDLL | | IVRSQNDKFN | | VSLTVKNTKD |
SAYNTRTIVH | | YSPNLVFSGI | | EAIQKDSCES | | NHNITCKVGY | | PFLRRGEMVT |
FKILFQFNTS | | YLMENVTIYL | | SATSDSEEPP | | ETLSDNVVNI | | SIPVKYEVGL |
QFYSSASEYH | | ISIAANETVP | | EVINSTEDIG | | NEINIFYLIR | | KSGSFPMPEL |
KLSISFPNMT | | SNGYPVLYPT | | GLSSSENANC | | RPHIFEDPFS | | INSGKKMTTS |
TDHLKRGTIL | | DCNTCKFATI | | TCNLTSSDIS | | QVNVSLILWK | | PTFIKSYFSS |
LNLTIRGELR | | SENASLVLSS | | SNQKRELAIQ | | ISKDGLPGRV | | PLWVILLSAF |
AGLLLLMLLI | | LALWKIGFFK | | RPLKKKMEK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Briesewitz R., Epstein M.R., Marcantonio E.E. (1993). Expression of native and truncated forms of the human integrin alpha 1 subunit. J. Biol. Chem. 268: 2989—2996. PMID 8428973
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6134 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P56199 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|