IFNGR1

IFNGR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1FG9, 1FYH, 1JRH

Ідентифікатори
Символи IFNGR1, CD119, IFNGR, IMD27A, IMD27B, interferon gamma receptor 1
Зовнішні ІД OMIM: 107470 MGI: 107655 HomoloGene: 359 GeneCards: IFNGR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• interferon-gamma receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• GO:0019974 cytokine binding
• GO:0016518 cytokine receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• integral component of plasma membrane
• мембрана
• клітинна мембрана

Біологічний процес

• response to virus
• regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• cytokine-mediated signaling pathway
• microglial cell activation
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• astrocyte activation
• negative regulation of amyloid-beta clearance
• positive regulation of amyloid-beta formation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3459
15979
Ensembl
ENSG00000027697
ENSMUSG00000020009
UniProt
P15260
P15261
RefSeq (мРНК)
NM_000416
NM_001363526
NM_001363527
NM_010511
RefSeq (білок)
NP_000407
NP_001350455
NP_001350456
NP_034641
Локус (UCSC) Хр. 6: 137.2 – 137.22 Mb Хр. 10: 19.47 – 19.49 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

IFNGR1 (англ. Interferon gamma receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 54 405[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MALLFLLPLVMQGVSRAEMGTADLGPSSVPTPTNVTIESYNMNPIVYWEY
QIMPQVPVFTVEVKNYGVKNSEWIDACINISHHYCNISDHVGDPSNSLWV
RVKARVGQKESAYAKSEEFAVCRDGKIGPPKLDIRKEEKQIMIDIFHPSV
FVNGDEQEVDYDPETTCYIRVYNVYVRMNGSEIQYKILTQKEDDCDEIQC
QLAIPVSSLNSQYCVSAEGVLHVWGVTTEKSKEVCITIFNSSIKGSLWIP
VVAALLLFLVLSLVFICFYIKKINPLKEKSIILPKSLISVVRSATLETKP
ESKYVSLITSYQPFSLEKEVVCEEPLSPATVPGMHTEDNPGKVEHTEELS
SITEVVTTEENIPDVVPGSHLTPIERESSSPLSSNQSEPGSIALNSYHSR
NCSESDHSRNGFDTDSSCLESHSSLSDSEFPPNNKGEIKTEGQELITVIK
APTSFGYDKPHVLVDLLVDDSGKESLIGYRPTEDSKEFS

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Aguet M., Dembic Z., Merlin G. (1988). Molecular cloning and expression of the human interferon-gamma receptor. Cell. 55: 273—280. PMID 2971451 DOI:10.1016/0092-8674(88)90050-5
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Stueber D., Friedlein A., Fountoulakis M., Lahm H.-W., Garotta G. (1993). Alignment of disulfide bonds of the extracellular domain of the interferon gamma receptor and investigation of their role in biological activity. Biochemistry. 32: 2423—2430. PMID 8443182 DOI:10.1021/bi00060a038
  • Thye T., Burchard G.D., Nilius M., Mueller-Myhsok B., Horstmann R.D. (2003). Genomewide linkage analysis identifies polymorphism in the human interferon-gamma receptor affecting Helicobacter pylori infection. Am. J. Hum. Genet. 72: 448—453. PMID 12516030 DOI:10.1086/367714

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5439 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P15260 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350