PROM1

Ідентифікатори

Символи

PROM1, AC133, CD133, CORD12, MCDR2, MSTP061, PROML1, RP41, STGD4, prominin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604365 MGI: 1100886 HomoloGene: 4390 GeneCards: PROM1

Пов'язані генетичні захворювання

карієс зубів, retinitis pigmentosa 41, cone-rod dystrophy 12, cone-rod dystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actinin binding • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cholesterol binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • везикула • cell projection • мембрана • клітинна мембрана • photoreceptor outer segment • integral component of plasma membrane • війка • cell surface • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • photoreceptor outer segment membrane • екзосома • microvillus membrane • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • міжклітинний простір • Мікроворсинки • prominosome
Біологічний процес	• retina layer formation • camera-type eye photoreceptor cell differentiation • retina morphogenesis in camera-type eye • glomerular parietal epithelial cell differentiation • glomerular visceral epithelial cell differentiation • photoreceptor cell maintenance • positive regulation of nephron tubule epithelial cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8842


19126

Ensembl


ENSG00000007062


ENSMUSG00000029086

UniProt


O43490


O54990

RefSeq (мРНК)

NM_001145847 NM_001145848 NM_001145849 NM_001145850 NM_001145851
NM_001145852 NM_006017 NM_001371406 NM_001371407 NM_001371408

NM_001163577 NM_001163578 NM_001163581 NM_001163582 NM_001163583
NM_001163584 NM_001163585 NM_008935

RefSeq (білок)

NP_001139319 NP_001139320 NP_001139321 NP_001139322 NP_001139323
NP_001139324 NP_006008 NP_001358335 NP_001358336 NP_001358337

NP_001157049 NP_001157050 NP_001157053 NP_001157054 NP_001157055
NP_001157056 NP_001157057 NP_032961

Локус (UCSC)

Хр. 4: 15.96 – 16.08 Mb

Хр. 5: 44.15 – 44.26 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PROM1 (англ. Prominin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 865 амінокислот, а молекулярна маса — 97 202^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALVLGSLLL	LGLCGNSFSG	GQPSSTDAPK	AWNYELPATN	YETQDSHKAG
PIGILFELVH	IFLYVVQPRD	FPEDTLRKFL	QKAYESKIDY	DKPETVILGL
KIVYYEAGII	LCCVLGLLFI	ILMPLVGYFF	CMCRCCNKCG	GEMHQRQKEN
GPFLRKCFAI	SLLVICIIIS	IGIFYGFVAN	HQVRTRIKRS	RKLADSNFKD
LRTLLNETPE	QIKYILAQYN	TTKDKAFTDL	NSINSVLGGG	ILDRLRPNII
PVLDEIKSMA	TAIKETKEAL	ENMNSTLKSL	HQQSTQLSSS	LTSVKTSLRS
SLNDPLCLVH	PSSETCNSIR	LSLSQLNSNP	ELRQLPPVDA	ELDNVNNVLR
TDLDGLVQQG	YQSLNDIPDR	VQRQTTTVVA	GIKRVLNSIG	SDIDNVTQRL
PIQDILSAFS	VYVNNTESYI	HRNLPTLEEY	DSYWWLGGLV	ICSLLTLIVI
FYYLGLLCGV	CGYDRHATPT	TRGCVSNTGG	VFLMVGVGLS	FLFCWILMII
VVLTFVFGAN	VEKLICEPYT	SKELFRVLDT	PYLLNEDWEY	YLSGKLFNKS
KMKLTFEQVY	SDCKKNRGTY	GTLHLQNSFN	ISEHLNINEH	TGSISSELES
LKVNLNIFLL	GAAGRKNLQD	FAACGIDRMN	YDSYLAQTGK	SPAGVNLLSF
AYDLEAKANS	LPPGNLRNSL	KRDAQTIKTI	HQQRVLPIEQ	SLSTLYQSVK
ILQRTGNGLL	ERVTRILASL	DFAQNFITNN	TSSVIIEETK	KYGRTIIGYF
EHYLQWIEFS	ISEKVASCKP	VATALDTAVD	VFLCSYIIDP	LNLFWFGIGK
ATVFLLPALI	FAVKLAKYYR	RMDSEDVYDD	VETIPMKNME	NGNNGYHKDH
VYGIHNPVMT	SPSQH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, війках.

Література

Yu Y., Flint A., Dvorin E.L., Bischoff J. (2002). AC133-2, a novel isoform of human AC133 stem cell antigen. J. Biol. Chem. 277: 20711—20716. PMID 12042327 DOI:10.1074/jbc.M202349200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fargeas C.A., Huttner W.B., Corbeil D. (2007). Nomenclature of prominin-1 (CD133) splice variants - an update. Tissue Antigens. 69: 602—606. PMID 17498271 DOI:10.1111/j.1399-0039.2007.00825.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PROM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9454 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O43490 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350