CDH2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1NCG, 1NCH, 1NCI, 1NCJ, 1OP4, 2QVI, 3Q2W, 4NUM, 4NUP, 4NUQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDH2, CD325, CDHN, CDw325, NCAD, cadherin 2, ACOGS, ARVD14 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 114020 MGI: 88355 HomoloGene: 20424 GeneCards: CDH2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • gamma-catenin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • protein phosphatase binding • alpha-catenin binding • protein kinase binding • beta-catenin binding • identical protein binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • intercalated disc • cell-cell junction • focal adhesion • plasma membrane raft • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • синапс • basolateral plasma membrane • apical plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • catenin complex • fascia adherens • екзосома • lamellipodium • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Сарколема • endoplasmic reticulum lumen • cell surface • міжклітинні контакти • GO:0005578 Позаклітинна матриця • integral component of plasma membrane • neuron projection • apical part of cell • collagen-containing extracellular matrix • integral component of presynaptic active zone membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane |
---|
Біологічний процес | • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • blood vessel morphogenesis • homeostasis of number of cells • positive regulation of muscle cell differentiation • regulation of postsynaptic density protein 95 clustering • glial cell differentiation • neuroepithelial cell differentiation • cell-cell adhesion mediated by cadherin • radial glial cell differentiation • neuronal stem cell population maintenance • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • telencephalon development • neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly • positive regulation of synaptic vesicle clustering • адгезія клітин • regulation of signal transduction • cerebral cortex development • striated muscle cell differentiation • adherens junction organization • cell migration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • brain morphogenesis • посттрансляційна модифікація • protein localization to plasma membrane • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • synapse assembly • regulation of axonogenesis • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001295105 NP_001783 NP_001783.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 27.93 – 28.18 Mb | Хр. 18: 16.72 – 16.94 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDH2 (англ. Cadherin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 99 809[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCRIAGALRT | | LLPLLAALLQ | | ASVEASGEIA | | LCKTGFPEDV | | YSAVLSKDVH |
EGQPLLNVKF | | SNCNGKRKVQ | | YESSEPADFK | | VDEDGMVYAV | | RSFPLSSEHA |
KFLIYAQDKE | | TQEKWQVAVK | | LSLKPTLTEE | | SVKESAEVEE | | IVFPRQFSKH |
SGHLQRQKRD | | WVIPPINLPE | | NSRGPFPQEL | | VRIRSDRDKN | | LSLRYSVTGP |
GADQPPTGIF | | IINPISGQLS | | VTKPLDREQI | | ARFHLRAHAV | | DINGNQVENP |
IDIVINVIDM | | NDNRPEFLHQ | | VWNGTVPEGS | | KPGTYVMTVT | | AIDADDPNAL |
NGMLRYRIVS | | QAPSTPSPNM | | FTINNETGDI | | ITVAAGLDRE | | KVQQYTLIIQ |
ATDMEGNPTY | | GLSNTATAVI | | TVTDVNDNPP | | EFTAMTFYGE | | VPENRVDIIV |
ANLTVTDKDQ | | PHTPAWNAVY | | RISGGDPTGR | | FAIQTDPNSN | | DGLVTVVKPI |
DFETNRMFVL | | TVAAENQVPL | | AKGIQHPPQS | | TATVSVTVID | | VNENPYFAPN |
PKIIRQEEGL | | HAGTMLTTFT | | AQDPDRYMQQ | | NIRYTKLSDP | | ANWLKIDPVN |
GQITTIAVLD | | RESPNVKNNI | | YNATFLASDN | | GIPPMSGTGT | | LQIYLLDIND |
NAPQVLPQEA | | ETCETPDPNS | | INITALDYDI | | DPNAGPFAFD | | LPLSPVTIKR |
NWTITRLNGD | | FAQLNLKIKF | | LEAGIYEVPI | | IITDSGNPPK | | SNISILRVKV |
CQCDSNGDCT | | DVDRIVGAGL | | GTGAIIAILL | | CIIILLILVL | | MFVVWMKRRD |
KERQAKQLLI | | DPEDDVRDNI | | LKYDEEGGGE | | EDQDYDLSQL | | QQPDTVEPDA |
IKPVGIRRMD | | ERPIHAEPQY | | PVRSAAPHPG | | DIGDFINEGL | | KAADNDPTAP |
PYDSLLVFDY | | EGSGSTAGSL | | SSLNSSSSGG | | EQDYDYLNDW | | GPRFKKLADM |
YGGGDD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Reid R.A., Hemperly J.J. (1990). Human N-cadherin: nucleotide and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 18: 5896—5896. PMID 2216790 DOI:10.1093/nar/18.19.5896
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wallis J.A., Fox M., Walsh F.S. (1994). Structure of the human N-cadherin gene: YAC analysis and fine chromosomal mapping to 18q11.2. Genomics. 22: 172—179. PMID 7959764 DOI:10.1006/geno.1994.1358
- Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
- Salomon D., Ayalon O., Patel-King R., Hynes R.O., Geiger B. (1992). Extrajunctional distribution of N-cadherin in cultured human endothelial cells. J. Cell Sci. 102: 7—17. PMID 1500442
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1759 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P19022 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|