CCR6

CCR6
Ідентифікатори
Символи CCR6, BN-1, C-C CKR-6, CC-CKR-6, CCR-6, CD196, CKR-L3, CKRL3, CMKBR6, DCR2, DRY6, GPR29, GPRCY4, STRL22, C-C motif chemokine receptor 6
Зовнішні ІД OMIM: 601835 MGI: 1333797 HomoloGene: 3214 GeneCards: CCR6
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• G protein-coupled receptor activity
• signal transducer activity
• chemokine receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• C-C chemokine receptor activity
• C-C chemokine binding
• signaling receptor activity
• chemokine binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• внутрішньоклітинний
• cell surface
• sperm midpiece
• sperm flagellum
• sperm principal piece
• sperm plasma membrane
• external side of plasma membrane

Біологічний процес

• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• positive regulation of epithelial cell migration
• dendritic cell chemotaxis
• cellular defense response
• humoral immune response
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• positive regulation of dendritic cell chemotaxis
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• calcium-mediated signaling
• хемотаксис
• cell chemotaxis
• chemokine-mediated signaling pathway
• leukocyte migration involved in inflammatory response
• isotype switching to IgA isotypes
• positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation
• lymphocyte migration
• T cell migration
• thymocyte migration
• DN2 thymocyte differentiation
• DN3 thymocyte differentiation
• regulation of T cell migration
• G protein-coupled receptor signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1235
12458
Ensembl
ENSG00000112486
ENSMUSG00000040899
UniProt
P51684
O54689
RefSeq (мРНК)
NM_031409
NM_004367
NM_001394582
NM_001190333
NM_001190334
NM_001190335
NM_001190336
NM_001190337
NM_001190338
NM_009835
RefSeq (білок)
NP_004358
NP_113597
NP_001177262
NP_001177263
NP_001177264
NP_001177265
NP_001177266
NP_001177267
NP_033965
Локус (UCSC) Хр. 6: 167.11 – 167.14 Mb Хр. 17: 8.45 – 8.48 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CCR6 (англ. C-C motif chemokine receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 494[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVP
IAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLP
FWAVSHATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQA
TKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISSSTFVFNQKYNTQGSDVCEPK
YQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRH
KAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTV
TEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAG
RYSENISRQTSETADNDNASSFTM

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Zaballos A., Varona R., Gutierrez J., Lind P., Marquez G. (1996). Molecular cloning and RNA expression of two new human chemokine receptor-like genes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 846—853. PMID 8886020 DOI:10.1006/bbrc.1996.1595
  • Liao F., Lee H.-H., Farber J.M. (1997). Cloning of STRL22, a new human gene encoding a G-protein-coupled receptor related to chemokine receptors and located on chromosome 6q27. Genomics. 40: 175—180. PMID 9070937 DOI:10.1006/geno.1996.4544
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ai L.S., Liao F. (2002). Mutating the four extracellular cysteines in the chemokine receptor CCR6 reveals their differing roles in receptor trafficking, ligand binding, and signaling. Biochemistry. 41: 8332—8341. PMID 12081481 DOI:10.1021/bi025855y
  • Roehrl J., Yang D., Oppenheim J.J., Hehlgans T. (2010). Specific binding and chemotactic activity of mBD4 and its functional orthologue hBD2 to CCR6-expressing cells. J. Biol. Chem. 285: 7028—7034. PMID 20068036 DOI:10.1074/jbc.M109.091090
  • Ito T., Carson W.F. IV, Cavassani K.A., Connett J.M., Kunkel S.L. (2011). CCR6 as a mediator of immunity in the lung and gut. Exp. Cell Res. 317: 613—619. PMID 21376174 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.12.018

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CCR6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1607 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P51684 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350