TNFRSF1A

TNFRSF1A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1EXT, 1FT4, 1ICH, 1NCF, 1TNR

Ідентифікатори
Символи TNFRSF1A, CD120a, FPF, MS5, TBP1, TNF-R, TNF-R-I, TNF-R55, TNFAR, TNFR1, TNFR1-d2, TNFR55, TNFR60, p55, p55-R, p60, tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, TNF receptor superfamily member 1A
Зовнішні ІД OMIM: 191190 MGI: 1314884 HomoloGene: 828 GeneCards: TNFRSF1A
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз, primary biliary cholangitis, autosomal dominant familial periodic fever[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
tumor necrosis factor-activated receptor activity
tumor necrosis factor binding
identical protein binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
комплекс Ґольджі
мембрана
Golgi membrane
receptor complex
клітинна мембрана
integral component of plasma membrane
extracellular region
cell surface
мітохондрія
membrane raft
міжклітинний простір
tumor necrosis factor receptor superfamily complex

Біологічний процес

regulation of apoptotic process
prostaglandin metabolic process
defense response
positive regulation of ceramide biosynthetic process
positive regulation of inflammatory response
regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
response to lipopolysaccharide
cellular response to mechanical stimulus
death-inducing signaling complex assembly
regulation of cell population proliferation
defense response to bacterium
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
GO:0022415 viral process
I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
negative regulation of inflammatory response
regulation of establishment of endothelial barrier
extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0097285 апоптоз
inflammatory response
cell surface receptor signaling pathway
positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein
protein localization to plasma membrane
cytokine-mediated signaling pathway
aortic valve development
pulmonary valve development
negative regulation of extracellular matrix constituent secretion
negative regulation of cardiac muscle hypertrophy
positive regulation of apoptotic process involved in morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7132
21937
Ensembl
ENSG00000067182
ENSMUSG00000030341
UniProt
P19438
P25118
RefSeq (мРНК)
NM_001065
NM_001346091
NM_001346092
NM_011609
RefSeq (білок)
NP_001056
NP_001333020
NP_001333021
NP_035739
Локус (UCSC) Хр. 12: 6.33 – 6.34 Mb Хр. 6: 125.33 – 125.34 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNFRSF1A (англ. TNF receptor superfamily member 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 455 амінокислот, а молекулярна маса — 50 495[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGLSTVPDLLLPLVLLELLVGIYPSGVIGLVPHLGDREKRDSVCPQGKYI
HPQNNSICCTKCHKGTYLYNDCPGPGQDTDCRECESGSFTASENHLRHCL
SCSKCRKEMGQVEISSCTVDRDTVCGCRKNQYRHYWSENLFQCFNCSLCL
NGTVHLSCQEKQNTVCTCHAGFFLRENECVSCSNCKKSLECTKLCLPQIE
NVKGTEDSGTTVLLPLVIFFGLCLLSLLFIGLMYRYQRWKSKLYSIVCGK
STPEKEGELEGTTTKPLAPNPSFSPTPGFTPTLGFSPVPSSTFTSSSTYT
PGDCPNFAAPRREVAPPYQGADPILATALASDPIPNPLQKWEDSAHKPQS
LDTDDPATLYAVVENVPPLRWKEFVRRLGLSDHEIDRLELQNGRCLREAQ
YSMLATWRRRTPRREATLELLGRVLRDMDLLGCLEDIEEALCGPAALPPA
PSLLR

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

  • Gray P.W., Barrett K., Chantry D., Turner M., Feldman M. (1990). Cloning of human tumor necrosis factor (TNF) receptor cDNA and expression of recombinant soluble TNF-binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 7380—7384. PMID 2170974 DOI:10.1073/pnas.87.19.7380
  • Fuchs P., Strehl S., Dworzak M., Himmler A., Ambros P.F. (1992). Structure of the human TNF receptor 1 (p60) gene (TNFR1) and localization to chromosome 12p13. Genomics. 13: 219—224. PMID 1315717 DOI:10.1016/0888-7543(92)90226-I
  • Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sanz L., Sanchez P., Lallena M.-J., Diaz-Meco M.T., Moscat J. (1999). The interaction of p62 with RIP links the atypical PKCs to NF-kappaB activation. EMBO J. 18: 3044—3053. PMID 10356400 DOI:10.1093/emboj/18.11.3044
  • Hildt E., Oess S. (1999). Identification of Grb2 as a novel binding partner of tumor necrosis factor (TNF) receptor I. J. Exp. Med. 189: 1707—1714. PMID 10359574 DOI:10.1084/jem.189.11.1707

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TNFRSF1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11916 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P19438 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350