TLR9

TLR9
Ідентифікатори
Символи TLR9, CD289, toll like receptor 9
Зовнішні ІД OMIM: 605474 MGI: 1932389 HomoloGene: 68126 GeneCards: TLR9
Реагує на сполуку
гідроксихлорохін, agatolimod sodium[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• siRNA binding
• interleukin-1 receptor binding
• transmembrane signaling receptor activity
• 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity
• protein homodimerization activity
• unmethylated CpG binding
• GO:0008329 pattern recognition receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• ендосома
• endoplasmic reticulum membrane
• мембрана
• early phagosome
• Golgi membrane
• клітинна мембрана
• extracellular region
• basolateral plasma membrane
• apical plasma membrane
• ендоплазматичний ретикулум
• phagocytic vesicle
• endolysosome membrane
• лізосома
• endosome membrane
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• міжклітинний простір
• endolysosome

Біологічний процес

• positive regulation of interleukin-18 production
• positive regulation of toll-like receptor signaling pathway
• positive regulation of inflammatory response
• positive regulation of interleukin-12 production
• аксоноґенеза
• positive regulation of interleukin-10 production
• процес імунної системи
• positive regulation of JUN kinase activity
• negative regulation of interleukin-6 production
• I-kappaB phosphorylation
• positive regulation of JNK cascade
• positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process
• MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway
• negative regulation of interleukin-8 production
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity
• negative regulation of toll-like receptor signaling pathway
• defense response to bacterium
• maintenance of gastrointestinal epithelium
• positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• positive regulation of interleukin-8 production
• positive regulation of interleukin-6 production
• positive regulation of tumor necrosis factor production
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• positive regulation of chemokine production
• tumor necrosis factor production
• toll-like receptor 9 signaling pathway
• вроджений імунітет
• inflammatory response
• response to molecule of bacterial origin
• negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• positive regulation of interferon-beta production
• toll-like receptor signaling pathway
• phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process
• positive regulation of immunoglobulin production
• positive regulation of B cell proliferation
• regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway
• positive regulation of MAPK cascade
• regulation of B cell differentiation
• positive regulation of B cell activation
• positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• defense response to virus

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
54106
81897
Ensembl
ENSG00000239732
ENSMUSG00000045322
UniProt
Q9NR96
Q9EQU3
RefSeq (мРНК)
NM_138688
NM_017442
NM_031178
RefSeq (білок)
NP_059138
NP_112455
Локус (UCSC) Хр. 3: 52.22 – 52.23 Mb Хр. 9: 106.1 – 106.1 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TLR9 (англ. Toll like receptor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 115 860[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGFCRSALHPLSLLVQAIMLAMTLALGTLPAFLPCELQPHGLVNCNWLFL
KSVPHFSMAAPRGNVTSLSLSSNRIHHLHDSDFAHLPSLRHLNLKWNCPP
VGLSPMHFPCHMTIEPSTFLAVPTLEELNLSYNNIMTVPALPKSLISLSL
SHTNILMLDSASLAGLHALRFLFMDGNCYYKNPCRQALEVAPGALLGLGN
LTHLSLKYNNLTVVPRNLPSSLEYLLLSYNRIVKLAPEDLANLTALRVLD
VGGNCRRCDHAPNPCMECPRHFPQLHPDTFSHLSRLEGLVLKDSSLSWLN
ASWFRGLGNLRVLDLSENFLYKCITKTKAFQGLTQLRKLNLSFNYQKRVS
FAHLSLAPSFGSLVALKELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLRLQM
NFINQAQLGIFRAFPGLRYVDLSDNRISGASELTATMGEADGGEKVWLQP
GDLAPAPVDTPSSEDFRPNCSTLNFTLDLSRNNLVTVQPEMFAQLSHLQC
LRLSHNCISQAVNGSQFLPLTGLQVLDLSHNKLDLYHEHSFTELPRLEAL
DLSYNSQPFGMQGVGHNFSFVAHLRTLRHLSLAHNNIHSQVSQQLCSTSL
RALDFSGNALGHMWAEGDLYLHFFQGLSGLIWLDLSQNRLHTLLPQTLRN
LPKSLQVLRLRDNYLAFFKWWSLHFLPKLEVLDLAGNQLKALTNGSLPAG
TRLRRLDVSCNSISFVAPGFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGPLAS
ALQILDVSANPLHCACGAAFMDFLLEVQAAVPGLPSRVKCGSPGQLQGLS
IFAQDLRLCLDEALSWDCFALSLLAVALGLGVPMLHHLCGWDLWYCFHLC
LAWLPWRGRQSGRDEDALPYDAFVVFDKTQSAVADWVYNELRGQLEECRG
RWALRLCLEERDWLPGKTLFENLWASVYGSRKTLFVLAHTDRVSGLLRAS
FLLAQQRLLEDRKDVVVLVILSPDGRRSRYVRLRQRLCRQSVLLWPHQPS
GQRSFWAQLGMALTRDNHHFYNRNFCQGPTAE

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

  • Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 DOI:10.1371/journal.pone.0007803
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Doyle S.L., Jefferies C.A., Feighery C., O'Neill L.A. (2007). Signaling by Toll-like receptors 8 and 9 requires Bruton's tyrosine kinase. J. Biol. Chem. 282: 36953—36960. PMID 17932028 DOI:10.1074/jbc.M707682200
  • Du X., Poltorak A., Wei Y., Beutler B. (2000). Three novel mammalian Toll-like receptors: gene structure, expression, and evolution. Eur. Cytokine Netw. 11: 362—371. PMID 11022119
  • Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2000). Cloning and characterization of a sub-family of human Toll-like receptors: hTLR7, hTLR8 and hTLR9. Eur. Cytokine Netw. 11: 372—378. PMID 11022120

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q9NR96 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350