CSF1R

CSF1R
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2I0V, 2I0Y, 2I1M, 2OGV, 3BEA, 3DPK, 3KRJ, 3KRL, 3LCD, 3LCO, 4DKD, 4HW7, 4LIQ, 4R7H, 4R7I, 4WRL, 4WRM

Ідентифікатори
Символи CSF1R, C-FMS, CD115, CSF-1R, CSFR, FIM2, FMS, HDLS, M-CSF-R, colony stimulating factor 1 receptor, BANDDOS, HDLS1
Зовнішні ІД OMIM: 164770 MGI: 1339758 HomoloGene: 3817 GeneCards: CSF1R
шифр КФ 2.7.10.1
Пов'язані генетичні захворювання
Hereditary diffuse leukoencephalopathy with spheroids, adult-onset leukoencephalopathy with axonal spheroids and pigmented glia[1]
Реагує на сполуку
cediranib, crenolanib, linifanib, Пазопаніб, Emactuzumab, enmd-981693[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• protein tyrosine kinase activity
• protein kinase activity
• transferase activity
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
• kinase activity
• protein homodimerization activity
• ATP binding
• protein phosphatase binding
• macrophage colony-stimulating factor receptor activity
• GO:0019974 cytokine binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• receptor tyrosine kinase
• transmembrane signaling receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• integral component of plasma membrane
• мембрана
• cell surface
• CSF1-CSF1R complex
• нуклеоплазма
• клітинна мембрана
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• цитоплазма
• receptor complex

Біологічний процес

• negative regulation of cell population proliferation
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• positive regulation of protein serine/threonine kinase activity
• mammary gland duct morphogenesis
• positive regulation of cell motility
• macrophage colony-stimulating factor signaling pathway
• phosphatidylinositol-mediated signaling
• negative regulation of apoptotic process
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• axon guidance
• multicellular organism development
• monocyte differentiation
• macrophage differentiation
• ruffle organization
• positive regulation of cell migration
• cellular response to cytokine stimulus
• protein autophosphorylation
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• olfactory bulb development
• regulation of bone resorption
• phosphatidylinositol metabolic process
• protein phosphorylation
• positive regulation of protein tyrosine kinase activity
• cell-cell junction maintenance
• osteoclast differentiation
• вроджений імунітет
• regulation of actin cytoskeleton reorganization
• процес імунної системи
• inflammatory response
• positive regulation of protein phosphorylation
• forebrain neuron differentiation
• фосфорилювання
• cellular response to macrophage colony-stimulating factor stimulus
• positive regulation of cell population proliferation
• regulation of cell shape
• проліферація
• positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein
• cytokine-mediated signaling pathway
• кровотворення
• negative regulation of signal transduction
• диференціація клітин
• hematopoietic progenitor cell differentiation
• positive regulation of MAPK cascade
• response to ischemia
• microglial cell proliferation
• positive regulation by host of viral process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1436
12978
Ensembl
ENSG00000182578
ENSMUSG00000024621
UniProt
P07333
P09581
RefSeq (мРНК)
NM_001288705
NM_005211
NM_001349736
NM_001375320
NM_001375321
NM_001037859
NM_007779
RefSeq (білок)
NP_001275634
NP_005202
NP_001336665
NP_001362249
NP_001362250
NP_001032948
Локус (UCSC) Хр. 5: 150.05 – 150.11 Mb Хр. 18: 61.23 – 61.27 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CSF1R (англ. Colony stimulating factor 1 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 972 амінокислот, а молекулярна маса — 107 984[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEW
DGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLY
VKDPARPWNVLAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMR
HTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIP
GPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIPQQS
DFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPK
LANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRY
PPEVSVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVW
DDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIP
ISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRW
KIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLL
GACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYK
NIHLEKKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPL
ELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLA
RDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFS
LGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
PTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEH
LTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Visvader J., Verma I.M. (1989). Differential transcription of exon 1 of the human c-fms gene in placental trophoblasts and monocytes. Mol. Cell. Biol. 9: 1336—1341. PMID 2524648 DOI:10.1128/MCB.9.3.1336
  • Browning P.J., Bunn H.F., Cline A., Shuman M., Nienhuis A.W. (1986). 'Replacement' of COOH-terminal truncation of v-fms with c-fms sequences markedly reduces transformation potential. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7800—7804. PMID 3532121 DOI:10.1073/pnas.83.20.7800
  • Morley G.M., Uden M., Gullick W.J., Dibb N.J. (1999). Cell specific transformation by c-fms activating loop mutations is attributable to constitutive receptor degradation. Oncogene. 18: 3076—3084. PMID 10340379 DOI:10.1038/sj.onc.1202646
  • Taylor J.R., Brownlow N., Domin J., Dibb N.J. (2006). FMS receptor for M-CSF (CSF-1) is sensitive to the kinase inhibitor imatinib and mutation of Asp-802 to Val confers resistance. Oncogene. 25: 147—151. PMID 16170366 DOI:10.1038/sj.onc.1209007
  • Hiraga T., Nakamura H. (2009). Imatinib mesylate suppresses bone metastases of breast cancer by inhibiting osteoclasts through the blockade of c-Fms signals. Int. J. Cancer. 124: 215—222. PMID 18814279 DOI:10.1002/ijc.23903

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CSF1R переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Colony stimulating factor 1 receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2433 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
  6. ↑ UniProt, P07333 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350