ITGA6

Ідентифікатори

Символи

ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, integrin subunit alpha 6, JEB6

Зовнішні ІД

OMIM: 147556 MGI: 96605 HomoloGene: 20091 GeneCards: ITGA6

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • laminin binding • neuregulin binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • insulin-like growth factor I binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • basal part of cell • клітинна мембрана • hemidesmosome • базальна мембрана • cell surface • integrin complex • basal plasma membrane • basolateral plasma membrane • external side of plasma membrane • integrin alpha6-beta4 complex • Філоподія
Біологічний процес	• cellular response to extracellular stimulus • hemidesmosome assembly • renal system development • nail development • positive regulation of cell-cell adhesion • filopodium assembly • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • extracellular matrix organization • odontogenesis of dentin-containing tooth • cell-substrate adhesion • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • адгезія клітин • cell adhesion mediated by integrin • brown fat cell differentiation • positive regulation of apoptotic process • cell-substrate junction assembly • integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of phosphorylation • cell-matrix adhesion • digestive tract development • ectodermal cell differentiation • leukocyte migration • skin development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • amelogenesis • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of cell-substrate adhesion • positive regulation of cell migration • cell-cell adhesion • positive regulation of neuron projection development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3655


16403

Ensembl


ENSG00000091409


ENSMUSG00000027111

UniProt


P23229


Q61739

RefSeq (мРНК)

NM_000210 NM_001079818 NM_001316306 NM_001365529 NM_001365530
NM_001394928


NM_001277970 NM_008397

RefSeq (білок)


NP_000201 NP_001073286 NP_001303235 NP_001352458 NP_001352459


NP_001264899 NP_032423 NP_001393187

Локус (UCSC)

Хр. 2: 172.43 – 172.51 Mb

Хр. 2: 71.58 – 71.69 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ITGA6 (англ. Integrin subunit alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 126 606^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAGQLCLL	YLSAGLLSRL	GAAFNLDTRE	DNVIRKYGDP	GSLFGFSLAM
HWQLQPEDKR	LLLVGAPRAE	ALPLQRANRT	GGLYSCDITA	RGPCTRIEFD
NDADPTSESK	EDQWMGVTVQ	SQGPGGKVVT	CAHRYEKRQH	VNTKQESRDI
FGRCYVLSQN	LRIEDDMDGG	DWSFCDGRLR	GHEKFGSCQQ	GVAATFTKDF
HYIVFGAPGT	YNWKGIVRVE	QKNNTFFDMN	IFEDGPYEVG	GETEHDESLV
PVPANSYLGL	LFLTSVSYTD	PDQFVYKTRP	PREQPDTFPD	VMMNSYLGFS
LDSGKGIVSK	DEITFVSGAP	RANHSGAVVL	LKRDMKSAHL	LPEHIFDGEG
LASSFGYDVA	VVDLNKDGWQ	DIVIGAPQYF	DRDGEVGGAV	YVYMNQQGRW
NNVKPIRLNG	TKDSMFGIAV	KNIGDINQDG	YPDIAVGAPY	DDLGKVFIYH
GSANGINTKP	TQVLKGISPY	FGYSIAGNMD	LDRNSYPDVA	VGSLSDSVTI
FRSRPVINIQ	KTITVTPNRI	DLRQKTACGA	PSGICLQVKS	CFEYTANPAG
YNPSISIVGT	LEAEKERRKS	GLSSRVQFRN	QGSEPKYTQE	LTLKRQKQKV
CMEETLWLQD	NIRDKLRPIP	ITASVEIQEP	SSRRRVNSLP	EVLPILNSDE
PKTAHIDVHF	LKEGCGDDNV	CNSNLKLEYK	FCTREGNQDK	FSYLPIQKGV
PELVLKDQKD	IALEITVTNS	PSNPRNPTKD	GDDAHEAKLI	ATFPDTLTYS
AYRELRAFPE	KQLSCVANQN	GSQADCELGN	PFKRNSNVTF	YLVLSTTEVT
FDTPDLDINL	KLETTSNQDN	LAPITAKAKV	VIELLLSVSG	VAKPSQVYFG
GTVVGEQAMK	SEDEVGSLIE	YEFRVINLGK	PLTNLGTATL	NIQWPKEISN
GKWLLYLVKV	ESKGLEKVTC	EPQKEINSLN	LTESHNSRKK	REITEKQIDD
NRKFSLFAER	KYQTLNCSVN	VNCVNIRCPL	RGLDSKASLI	LRSRLWNSTF
LEEYSKLNYL	DILMRAFIDV	TAAAENIRLP	NAGTQVRVTV	FPSKTVAQYS
GVPWWIILVA	ILAGILMLAL	LVFILWKCGF	FKRSRYDDSV	PRYHAVRIRK
EEREIKDEKY	IDNLEKKQWI	TKWNENESYS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hogervorst F., Kuikman I., Geurts van Kessel A., Sonnenberg A. (1991). Molecular cloning of the human alpha 6 integrin subunit. Alternative splicing of alpha 6 mRNA and chromosomal localization of the alpha 6 and beta 4 genes. Eur. J. Biochem. 199: 425—433. PMID 2070796 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16140.x
Tamura R.N., Cooper H.M., Collo G., Quaranta V. (1991). Cell type-specific integrin variants with alternative alpha chain cytoplasmic domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10183—10187. PMID 1946438 DOI:10.1073/pnas.88.22.10183
Catimel B., Parmentier S., Leung L.L., McGregor J.L. (1991). Separation of important new platelet glycoproteins (GPIa, GPIc, GPIc*, GPIIa and GMP-140) by F.P.L.C. Characterization by monoclonal antibodies and gas-phase sequencing. Biochem. J. 279: 419—425. PMID 1953640 DOI:10.1042/bj2790419
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Pawar S.C., Demetriou M.C., Nagle R.B., Bowden G.T., Cress A.E. (2007). Integrin alpha6 cleavage: a novel modification to modulate cell migration. Exp. Cell Res. 313: 1080—1089. PMID 17303120 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.01.006

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGA6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6142 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P23229 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350