MSR1

MSR1
Ідентифікатори
Символи MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Зовнішні ІД OMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• scavenger receptor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• low-density lipoprotein particle binding
• amyloid-beta binding
• cargo receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• endocytic vesicle membrane
• гіалоплазма
• клітинна мембрана
• Колаген
• integral component of plasma membrane
• мембрана
• low-density lipoprotein particle
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle

Біологічний процес

• cholesterol transport
• plasma lipoprotein particle clearance
• GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
• positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation
• ендоцитоз
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• lipoprotein transport
• positive regulation of cholesterol storage
• phagocytosis, engulfment
• negative regulation of gene expression
• amyloid-beta clearance

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4481
20288
Ensembl
ENSG00000038945
ENSMUSG00000025044
UniProt
P21757
P30204
RefSeq (мРНК)
NM_138716
NM_002445
NM_138715
NM_001363744
NM_001113326
NM_031195
RefSeq (білок)
NP_002436
NP_619729
NP_619730
NP_001350673
NP_001106797
NP_112472
Локус (UCSC) Хр. 8: 16.11 – 16.57 Mb Хр. 8: 40.03 – 40.1 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEQWDHFHNQQEDTDSCSESVKFDARSMTALLPPNPKNSPSLQEKLKSFK
AALIALYLLVFAVLIPLIGIVAAQLLKWETKNCSVSSTNANDITQSLTGK
GNDSEEEMRFQEVFMEHMSNMEKRIQHILDMEANLMDTEHFQNFSMTTDQ
RFNDILLQLSTLFSSVQGHGNAIDEISKSLISLNTTLLDLQLNIENLNGK
IQENTFKQQEEISKLEERVYNVSAEIMAMKEEQVHLEQEIKGEVKVLNNI
TNDLRLKDWEHSQTLRNITLIQGPPGPPGEKGDRGPTGESGPRGFPGPIG
PPGLKGDRGAIGFPGSRGLPGYAGRPGNSGPKGQKGEKGSGNTLTPFTKV
RLVGGSGPHEGRVEILHSGQWGTICDDRWEVRVGQVVCRSLGYPGVQAVH
KAAHFGQGTGPIWLNEVFCFGRESSIEECKIRQWGTRACSHSEDAGVTCT
L

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Resnick D., Chatterton J.E., Schwartz K., Slayter H., Krieger M. (1996). Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain. J. Biol. Chem. 271: 26924—26930. PMID 8900177 DOI:10.1074/jbc.271.43.26924
  • Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
  • Gough P.J., Greaves D.R., Gordon S. (1998). A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake. J. Lipid Res. 39: 531—543. PMID 9548586

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7376 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P21757 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.