CDH1

CDH1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y, 4ZT1, 4ZTE

Ідентифікатори
Символи CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin
Зовнішні ІД OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium ion binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ankyrin binding
• gamma-catenin binding
• beta-catenin binding
• GTPase activating protein binding
• зв'язування з іоном металу
• cell adhesion molecule binding
• cadherin binding
• identical protein binding
• cytoskeletal protein binding
• protein homodimerization activity

Клітинна компонента

• apical junction complex
• trans-Golgi network
• extracellular region
• perinuclear region of cytoplasm
• cortical actin cytoskeleton
• комплекс Ґольджі
• lamellipodium
• cytoplasmic side of plasma membrane
• ендосома
• lateral plasma membrane
• catenin complex
• actin cytoskeleton
• flotillin complex
• мембрана
• екзосома
• integral component of membrane
• міжклітинні контакти
• цитоплазма
• клітинна мембрана
• cell surface
• postsynapse
• glutamatergic synapse

Біологічний процес

• negative regulation of cell-cell adhesion
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
• cellular response to lithium ion
• адгезія клітин
• extracellular matrix organization
• cellular response to indole-3-methanol
• extracellular matrix disassembly
• synapse assembly
• pituitary gland development
• response to toxic substance
• response to organic substance
• neuron projection development
• adherens junction organization
• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
• entry of bacterium into host cell
• protein localization to plasma membrane
• cell-cell adhesion
• GO:0000767 cell morphogenesis
• cell-cell junction assembly
• регуляція експресії генів
• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
• negative regulation of cell migration
• positive regulation of protein import into nucleus
• cell-cell adhesion mediated by cadherin
• regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
999
12550
Ensembl
ENSG00000039068
ENSMUSG00000000303
UniProt
P12830
P09803
RefSeq (мРНК)
NM_004360
NM_001317184
NM_001317185
NM_001317186
NM_009864
RefSeq (білок)
NP_001304113
NP_001304114
NP_001304115
NP_004351
NP_033994
Локус (UCSC) Хр. 16: 68.74 – 68.84 Mb Хр. 8: 107.33 – 107.4 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGR
VLGRVNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLV
YAWDSTYRKFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLR
RQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTP
PVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILI
TVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADL
QGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTD
ADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQY
ILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFG
VGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDR
EDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESI
ILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQP
VEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRD
NVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPR
PANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNS
SESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

  • Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA. Mol. Biol. Rep. 17: 123—128. PMID 8459805 DOI:10.1007/BF00996219
  • Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754—1761. PMID 8185635 DOI:10.1006/bbrc.1994.1656
  • Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284—1290. PMID 8093045 DOI:10.1006/bbrc.1994.2321
  • Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin. Differentiation. 38: 67—71. PMID 3263290 DOI:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
  • Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246—4250. PMID 2349235 DOI:10.1073/pnas.87.11.4246
  • Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion. FEBS Lett. 355: 195—200. PMID 7982500 DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P12830 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350